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科研人员建立单细胞轨迹推断技术

总之,PhyloVelo是利用单细胞谱系和转录组数据重建细胞命运转变的新方法,具有高度的准确性和鲁棒性。PhyloVelo可以克服传统RNA velocity方法的局限性,并可以发现隐藏在转录组数据中

2023-08-03

单细胞精度揭示苔藓类植物地钱的成熟和衰老轨迹

苔藓植物是植物界最原始的类群之一,它们生长在湿润和阴暗的环境中,没有根、茎和叶等器官,也不能通过维管束进行水分和养分的输送。尽管苔藓植物在进化上具有重要性,并且拥有相对简单的植株构造,但是人们对于其细

2023-06-17

Development:解析愈伤组织中多能干细胞的发育轨迹

利用组织培养技术进行器官再生是植物营养繁殖和基因编辑等现代农业分子育种技术应用的基础。在经典的两步法组织培养技术中,人们首先在愈伤组织诱导培养基上利用高浓度生长素使外植体产生愈伤组织

2023-02-16

单细胞拉曼追踪细菌抗性进化轨迹研究中取得进展

抗生素抗性的频繁出现对现代医学提出挑战。探讨抗性的进化过程对遏制其全球传播至关重要。抗性进化过程涉及高度复杂的表型异质性响应。在抗生素处理下,基因完全相同的微生物菌群中会出现小部分可耐受抗生素的细胞

2023-02-14

科学家利用空间动态代谢组学确定人类肾脏分化中的代谢细胞命运轨迹

越来越多的研究结果表明,新陈代谢在细胞命运决定中发挥着重要的作用。然而,在空间上评估新陈代谢来验证组织微环境的异质性和细胞动态非常困难。

2022-12-15

Cell Reports小鼠胚胎早期内耳神经节单细胞转录组及其发育轨迹特征分析研究获进展

Cell Reports在线发表了题为Single-cell transcriptomic landscapes of the otic neuronal lineage at multiple early embryonic ages的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中

2022-03-28

NAT IMMUNOL:胰岛素信号建立了脂肪调节性T细胞的发育轨迹

具有调节表型的免疫细胞具有预防全身代谢紊乱的重要辅助功能,来自脂肪组织的调节性T细胞(Treg)能表达大量的过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(PPAR-γ),从而在生理条件下抑制效应T(Teff)细胞和其他免疫细胞类型的活性,保持胰岛素敏感性,进而控制全身代谢稳态。

2021-09-28

Molecular Plant:基于质核基因组变异揭示杂交稻的五大母本材料类群及杂交育种轨迹

  中国科学院院士、中科院分子植物科学卓越创新中心研究员韩斌研究组,在Molecular Plant在线发表了研究论文Cytoplasmic and nuclear genome variations of rice hybrids and their parents inform trajectory and strategy of h

2021-08-19

Science:利用RT-qPCR的Ct值可靠地估计流行病轨迹

2021年7月18日讯/生物谷BIOON/---目前的流行病监测方法依赖于病例数、检测阳性率和报告的死亡或住院人数。然而,由于测试的限制、不具代表性的抽样和报告的延迟,这些指标提供的情况是有限的,而且往往有偏差。随机横断面病毒学调查可以通过提供感染率的快照来克服其中的一些偏差,但目前在没有跨时间点抽样的情况下,几乎不能提供关于流行病轨迹的信息。在一项新的研究

2021-07-18

科学家成功成像并追踪视网膜中免疫细胞的神秘活动轨迹

2020年10月13日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志eLife上题为“Imaging single-cell blood flow in the smallest to largest vessels in the living retina”的研究报告中,来自洛克菲勒大学等机构的科学家们通过研究在眼睛后部活体视网膜中观察到了免疫细

2020-10-12