通过一种改造的细菌实现柳枝稷到乙醇的直接转换
一项研究发现,一种经过遗传改造的降解木质纤维素的细菌不仅能够把生物质纤维素转化成糖,还能把糖转化成乙醇燃料。利用植物生物质进行具有成本效率的生物燃料生产的一个主要障碍是利用微生物发酵制造乙醇之前的化学和酶预处理的成本。微生物工程的工作的方向因此一直放在了制造可以执行向乙醇的生物质转化的所有阶段的一种微生物菌株上,包括把植物纤维素分解成糖并且把得到的糖发酵成乙醇。
PLoS ONE:新型计算机模型或可监测机体感染后肠道菌群的动力学特性
感染性疾病常常让我们浑身不自在,近日,刊登在国际杂志PLoS ONE上的一篇研究论文中,来自布莱根妇女医院的研究人员利用特殊的计算机模型揭示了机体感染影响肠道天然菌群的分子机制,相关研究或可帮助临床医生们开发治疗胃肠道感染及炎症的新型疗法。
Nature:简化有关活细胞的计算方法
用于合成生物学的新颖基因控制系统的设计受数字逻辑支配。这必然是一种复杂的安排。现在Timothy Lu及其同事利用在自然细胞中所发现的模拟构造单元来在对数范畴内执行算术运算。这样的模拟回路(它们可以与数字回路集成)应能使采用更少的要素来进行在生物感应中要求宽的动态范围的复杂计算成为可能。
eLife:使用计算机模拟技术揭示病毒扩散的机制
2013年6月19日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,刊登在国际杂志eLife上的一篇研究报告中,来自布兰迪斯大学的研究者通过复杂的计算机模型和图形处理单元来揭示病毒结构与其外壳之间基因组数据的复杂关联。研究者Jason Perlmutter表示,我们希望通过此项研究来帮助改变病毒的装配从而使得病毒不能进行复制。
PLoS Comput Biol:新型计算机模型或为开发疼痛缓解的药物提供希望
近日,刊登在国际杂志PLOS Computational Biology上的一篇研究论文中,来自澳大利亚国立大学的研究人员通过研究疼痛缓解药物的具体作用机制,为新型疼痛疗法的开发提供了新的思路和依据。
计算机模拟有助于研究细菌的耐药性
据悉,一个关于氨基糖甙类抗生素与它们在细菌的作用位点之间相互作用的最新研究使用了计算机模拟来阐明这个机制,从而建议药物的修饰。 在这篇于7月21日发表在开放期刊《PLoS Computational Biology》上的文章中,波兰华沙大学以及美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员描述他们的细菌耐药机制的物质基础研究-抗生素的作用靶点即细菌核糖体RNA的突变。
:揭示RNA所起细胞作用的计算机程序
计算机工程师可能给医学界提供一种精确计算出蛋白质如何形成和发挥功能的新方法。 美国中佛罗里达大学助理教授Shaojie Zhang使用一种复杂的计算机程序分析RNA基序,即组成RNA的亚单元。 RNA与DNA和蛋白质是生命的三种构建单元。知道这三种构建单元如何合作和如何发生偏差将有助于理解是什么导致疾病以及如何治疗它们。
:上海药物所开发出离子通道电压敏感性的理论计算方法
每个残基对通道电压敏感性的贡献 膜蛋白的电压敏感能力是各种生理电信号存在和实现的基础。离子通道的电压敏感性一般是采用实验方法测量,把电生理数据拟合波尔兹曼分布获得相应参数。基于二态模型和平衡热力学理论,中科院上海药物研究所阳怀宇、高召兵、利民和蒋华良等研究人员发展了离子通道电压敏感性的理论计算方法。 该方法是迄今唯一可实际运用的电压敏感性理论计算方法。
超级计算机将在单个细胞尺度精确模拟“人脑”
据英国《每日邮报》网站4月15报道,人脑的能力或许会让现有机器相形见绌,但科学家们目前正打算让全球功能最强大的超级计算机变身为“人脑”。如果成功,那么,该“人造大脑”将彻底变革我们对阿尔茨海默病等神经疾病的理解,甚至让我们进一步洞悉人类如何思考、做决定等。