Nature Methods ：核苷酸转换模型（Nucleotide Transformer, NT）——解锁基因组预测的新纪元
该模型不仅能像阅读文本一样解读DNA序列，还能够预测基因组中的关键功能区域。
2024-12-12
Nat Genet：科学家开发出能识别驱动侵袭性癌症生长的肿瘤细胞的首个计算机算法
本文研究中，研究人员通过将SPRINTER算法应用于此前产生的61,914个乳腺癌细胞和卵巢癌细胞的数据集，揭示了不同基因组变异的单细胞率的增加，以及高增殖克隆群中与增殖相关的基因扩增的富集现象。
2024-12-26
Nature：计算蛋白质设计，AI如何重塑生物学的未来
2024-11-15
多项研究：定制化DNA“开关”；「AI算命」精准计算10年内死亡风险，准确率近80%!
人工智能正在开启生物医学领域的一场革命，它不仅让科学研究变得更加高效精准，还为疾病的预防、诊断和治疗带来了前所未有的可能性。
2024-11-14
Genome Biol：杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR，实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
Cell Research：朱永群/周艳联合揭示病原菌鞭毛马达旋转方向转换的分子机制
这项研究工作反驳了以往所有的关于鞭毛马达方向转换是因为C ring的结构外延这一假说，纠正了之前所有关于C ring的组装和结构的错误理解，改变了之前认为定子是完全固定在细菌内膜上的概念。
2024-09-04
科学家发现，TNF信号来源的转换是关键
在TSK细胞亚群中，这些自分泌来源的TNF会促进上皮-间质转化（EMT）的进展，并增强癌细胞的活动能力，使它们在肿瘤起始阶段更容易侵袭周围正常组织。
2024-07-24
计算机模拟+创新的体外实验模型！APL Bioeng：耶鲁大学科研团队运用先进模拟技术，揭秘乳腺癌细胞侵袭脂肪组织之谜
研究团队证实，癌细胞的活跃度与黏性、脂肪细胞的硬度以及ECM的约束力，共同决定了癌细胞是否能够成功侵入脂肪组织，以及侵入后的表现形式。
2024-08-22
Cell：西湖大学解明岐/浙江大学邵佳伟等设计用于细胞智能计算的三态门基因表达调控系统
该研究首次提出的基因电路“三态门”设计原则（TriLoS）以及设计、构建的多种基因调控三态门，为细胞计算领域提供了理论指导和技术创新，解决了现有研究中只能通过经验来盲目设计和反复试错的设计模式。
2024-08-04