JCIM：人类激酶计算机模型有望帮助开发新型癌症疗法
2019年4月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Journal of Chemical Information and Modeling上的研究报告中，来自加州理工州立大学的科学家们通过研究开发了一种人类MEK1蛋白计算机模型，MEK1是科学家们有望开发多种人类癌症疗法的潜在药物靶点。图片来源：theconversation.com当参与细胞增殖的分子信号错误时，癌细胞就
Nat Chem：超级计算机帮助“组装”大型蛋白质复合体
2019年4月1日 讯 /生物谷BIOON/ --红细胞中的血红蛋白分子通过以全有或全无的方式改变其形状来传输氧气。血红蛋白中相同蛋白质的四个拷贝像花瓣一样打开和关闭，在结构上相互耦合以相互作用。使用超级计算机，科学家们能够设计自组装的蛋白质，以组合和类似生命的分子，如血红蛋白。科学家表示，他们的方法可以应用于有用的技术，如药物靶向，人工能量收集，“智能”传感和建筑材料等。一个科学团队通过增加蛋白
财政部：罕见病药品依照3%征收率计算缴纳增值税
2月22日消息，财政部发布关于罕见病药品增值税政策的通知，自2019年3月1日起，增值税一般纳税人生产销售和批发、零售罕见病药品，可选择按照简易办法依照3%征收率计算缴纳增值税。上述纳税人选择简易办法计算缴纳增值税后，36个月内不得变更。自2019年3月1日起，对进口罕见病药品，减按3%征收进口环节增值税。以下为通知全文：关于罕见病药品增值税政策的通知财税〔2019〕24号各省、自治区、直辖市、计
羧酸还原酶催化机制的计算解析领域取得进展
羧酸还原酶（Carboxylic acid reductase， CAR）是一类多功能酶，广泛分布于细菌、真菌及部分植物体内，依赖辅因子ATP和NADPH，可高效催化由羧酸到醛的化学反应，不仅反应条件温和、底物谱宽泛、针对性强、可专一识别羧酸基团，还能解决化学合成法产生的环保压力和能源问题，显着降低生产过程中的资源与能源消耗。此外，CAR还可与醇脱氢酶、转氨酶和亚胺还原酶等形成级联反应，生成醇类、
研究开发新的表观遗传通路统计算法
11月30日，国际学术期刊Nature Methods 发表了中国科学院上海营养与健康研究院计算生物学研究所Andrew Teschendorff组的研究论文“Identification of differentially methylated cell types in epigenome-wide association studies”，报道了一种新的有助于识别与疾病相关的表观遗传通路的“
QB期刊 |RNA-seq数据计算方法大汇总
引言 分子生物学的中心法则自1958年由Francis Crick提出到今年正好60周年，它描述了“DNA制造RNA，RNA制造蛋白质”的遗传信息的标准流程 [1]。十年前，第二代RNA测序技术(RNA-seq)的诞生及其迅速发展使得研究者可以在对RNA序列没有任何先验信息的情况下高通量地对全转录组进行测序 [2]。现如今第二
Management Science：新计算方法可提高肾移植成功率
2018年9月6日 讯 /生物谷BIOON/ --终末肾功能衰竭的患者需要经常透析或新捐献的肾脏才能存活。供体肾脏的来源可以是尸体或找到自愿以及兼容的活体捐赠者（通常是家庭成员）。然后，进行医学和心理学测试以确定该供体是否确实是相容的。如果测试确定，例如，供体的肾脏不太可能被患者的身体接受，则该过程停止并重新开始寻找新的供体。（图片来源：www.pixabay.com）最近的一项创新是出现了一种称
Nat Commun: 先进计算方法加速药物靶向治疗的开发
2018年9月4日 讯 /生物谷BIOON/ --伦敦帝国理工学院，新加坡杜克国立大学医学院和比利时制药公司UCB合作发现了一种新的抗癫痫药物靶点和一种全新的方法，有望加速衰弱性疾病，如癫痫，的治疗与药物开发。作者等人合作开发了一种先进的计算方法来预测新的药物靶点。作为概念性验证，研究人员将他们的计算方法应用于癫痫的靶点与药物发现研究。临床前模型测试结果验证了该靶点的有效性以及药物阻断后的抗癫痫效
Sci Rep：计算机模拟能够预测疟疾的最新表型
2018年9月3日 讯 /生物谷BIOON/ --根据由“la Caixa”基金会支持的ISGlobal领导的一项研究，作者们发现了一类比世界卫生组织（WHO）定义的更严重的疟疾临床表型。结果表明，心力衰竭可能是疾病的致病机制，这对这些患者的临床管理会产生影响。尽管过去几十年取得了一定进展，但根据估计，2016年疟疾仍旧会造成近50万人死亡，其中大部分是儿童。确定严重疟疾的定义是为了确定那些有死亡
PLoS ONE：科学家找到计算轴突降解的新方法
2018年8月30日讯 /生物谷BIOON /——在哺乳动物神经系统发育过程中轴突会自然降解，但是在成年人神经退行性疾病中，相同的基因编码的细胞器调节异常则会破坏关键的结构。图片来源：PLOS ONE背根神经节(DRG)释放轴突神经生长因子（Nerve growth factor，NGF）是一个成熟的体外研究发育退化的生化和细胞生物学研究的实验模型。但是目前还缺乏可以准确测量轴突的降解的方法。为此