云计算再造新农业:用数据提高产量、做决策
在农业现代化不断推进的今天,传统农耕方式早已被抛弃,联合收割机、农业汽车等现代化的农业机械的大规模使用在迅速提高农作物的产量和质量。 而比起现代化的农业器械,还有一种方式可能会给农业生产带来翻天覆地的变化,那就是在云计算的基础上对农作物的基因组进行测序,从而从质上改变农作物的质量。通过改变农作物的基因,科学家们可以培育出营养水平更高的农作物。
JNCI:计算机模拟分析乳腺癌风险
科学家用数学模型显示,分析基因数据,伴随一系列其他危险因素,可以大大提高标示妇女患乳腺癌的风险最高的能力,。他们的研究表明,预防策略可以改善通过测试不仅癌症易感性基因如BRCA1和BRCA2,其中确定妇女的小百
百万基因组生物医学大数据计算
2014年9月18日讯 /生物谷BIOON/—9月18日,由生物谷主办的2014生物医疗大数据高峰论坛:生态与云,在上海长城假日酒店隆重开幕。深圳华大基因研究院副院长方林,在大会上做题为“百万基因组生物医学大数据计算
Astellas将利用超级计算机开展NTDs药物发现
2012年7月30日讯 /生物谷BIOON/ --安思泰来(Astellas)今天宣布,与东京工业大学签署药物发现联合研究协议,利用东京工业大学千万亿次超级计算机Tsubame 2.0,有效地发现候选药物,用于治疗由原生寄生虫(protozoan parasites)引发的疾病。
:利用计算机模拟方法揭示分子四维结构
利用计算机模拟(computer simulation)方法来揭示体内最小的构建单元(building block)的行为正在帮助科学家们确定分子在人类疾病中所起的作用。 在最近的一系列研究中,来自澳大利亚莫纳什大学生物医学科学学院的研究人员证实分子运动和分子相互作用在人体如何患上疾病、检测疾病和对疾病如何作出反应方面发挥着非常重要的作用。
Nat Commun:开发出基于基因组尺度的机体代谢和基因表达的计算机模型
加利福尼亚大学的研究者开发出了一种新的模型方法,其可以同时展示生物有机体体内的代谢和基因的表达过程。 Photo Credit: UC San Diego Jacobs School of Engineering 近日,来自加利福尼亚大学的研究者开发出了一种新的模型方法,其可以同时展示生物有机体体内的代谢和基因的表达过程。相关研究刊登在国际杂志Nature Communications上。
美国学者利用计算机模型研究HIV防控最佳方案
政府官员们希望用问卷调查的方式寻找阻断HIV传播的方法。而一些学者已经开始将目光转向计算机模型。布朗大学(美国常春藤联盟著名大学)的教授马歇尔在哥伦比亚大学做博士后时就开始了一项HIV计算机模型的研究。今年1月份来到布朗大学后他继续着自己的研究。“它反映出的是我们在现实世界所能看到的东西。”马歇尔教授是这么评价自己的模型的,“我们所做的就是找出最佳的干预方案以显着降低静脉吸毒者的HIV感染率。
AJHG:计算生物学所研究人员建立了研究人群基因交流历史和混合动力学机制的新方法
国际著名学术期刊《美国人类遗传学杂志》(AJHG)在线发表了上海生命科学研究院计算生物学所徐书华课题组的最新研究成果Exploring Population Admixture Dynamics via Empirical and Simulated Genome-Wide Distribution of Ancestral Chromosomal Segments。
Cell Reports:新计算模型揭示Sec蛋白通道功能
2012年10月20日 讯 /生物谷BIOON/ --在细胞中,Sec转位通道(Sec translocon)允许特异性的蛋白通过细胞膜。来自美国加州理工学院的研究人员首次模拟出Sec转位通道的生物学功能。这项成就需要将纳秒范围的时间尺度提高至分钟范围的时间尺度,比早期的模拟研究提高了六个多数量级。这项研究结果有助于人们详细地理解这种转位通道发挥功能的分子机制。
PNAS:利用硅片计算工具揭示纳米颗粒抑制胰腺癌转移机制
2012年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --医学界在设计和开发治疗诸如胰腺癌之类的致命性疾病的药物中获得新的深入认识和新的策略。通过利用硅片(in silico)计算工具来补充体外和体内实验的研究结果,研究人员在原子水平上理解纳米颗粒抑制胰腺瘤生长和转移的机制。