6小时识别病原菌的纳米孔宏基因组学方案
近日，英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。该优化后的研究方案针对细菌性下呼吸道感染，可从临床呼吸道样本中去除高达99.99％的宿主核酸，并利用纳米孔测序的实时检测在6小时内准确识别病原体和抗生素抗性基因。《Nature Biotechnology》杂志7月以封面文章的形式刊登了该项研究。细菌性下呼吸道
科学家利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱
近日，澳大利亚昆士兰大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Atlas of group Astreptococcalvaccine candidates compiled using large-scale comparative genomics”的文章，利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱。A群链球菌（Group Astreptococcus，GA
精神分裂症功能基因组学研究中取得进展
精神分裂症是一种以阳性症状、阴性症状和认知障碍为主要特征的严重精神疾病，目前影响了全球约1%的人口。由于病因复杂，反复发作以及大多在青壮年发病，精神分裂症严重影响患者生活，同时也给患者家属和社会带来了沉重的经济和精神负担。精神分裂症的遗传力高达80%左右，表明遗传因素在精神分裂症的发生中有重要作用。近年来，全基因组范围内的关联研究（GWAS）已鉴别到超过180个与精神分裂症显着相关的遗
2018年基因组学研究盘点
2018年12月21日/生物谷BIOON/---2018年即将过去，本期为大家带来的是2018年度基因组学领域研究的相关盘点，希望读者朋友们能够喜欢。1. Nature：改写教科书！中国科学家阐明保护卵母细胞独特表观基因组的新型机制！DOI: 10.1038/s41586-018-0751-5在哺乳动物中，雌性机体的卵母细胞数量往往有限，卵母细胞拥有一套独特的表观基因组，其甲基化程度相当于精子的一
整合基因组和组织学信息 基因组学公司联手开拓新前沿
10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学（spatial genomics）领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域，它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据，而且可以比较在组织不同部位的细胞中基因组信息的变化。这一技术在肿瘤学、神经科学和免疫学等疾
北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表，并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas、犬类数据库iDog、RNA编辑与疾病相关知识库EDK、植物RNA编辑数据库PED、人类长非编码RNA数
两篇Nature论文聚焦英国生物样本库中的基因组和表型数据
2018年10月13日/生物谷BIOON/---两个研究团队独立地在Nature期刊上发表两篇论文，描述了使用英国生物样本库（UK Biobank）中的全套数据开展的研究。第一个研究团队由来自英国、澳大利亚和瑞士的研究人员组成---他们搜索了英国生物样本库，从中寻找遗传变异和表型之间的关联性，以便填补这些数据中的空白。第二个研究团队由牛津大学的研究人员组成---他们使用英国生物样本库旨在将遗传数据
Autoimmunity：科学家成功开发出能研究细胞表观基因组学特性的新型工具
2018年9月2日 讯 /生物谷BIOON/ --如今研究人员都知道，表观基因组在控制DNA表达上扮演着关键角色，而且表观基因组的一系列改变与多种健康问题直接相关，比如癌症、自身免疫性障碍等多种疾病，但目前科学家们关于表观基因组并不是知道地很多，甚至也并没有工具去研究表观基因组。图片来源：CC0 Public Domain刊登在国际杂志Autoimmunity上的研究报告中，来自北卡罗来纳州立大学
寄生植物南方菟丝子基因组学研究取得进展
自然界绝大部分植物都通过叶片的光合作用和根部的水分和营养吸收维持自养生存，而寄生植物则是一类通过寄生在自养植物上获取能量和营养的植物。寄生植物独特的起源、演化和特殊生理生态长期以来吸引着研究者的目光。旋花科茎寄生植物菟丝子寄生行为在实验室中方便控制和观察，近年来已成为许多探索寄生植物生理生态和进化生物学的重要研究对象。为了解密菟丝子属植物的演化，同时也为以菟丝子为模型的寄生植物生理生态研究提供重要
樟科植物系统发育基因组学研究获进展
樟科山胡椒属树种经济用途广泛。山胡椒属多数种类的种子富含脂肪，可供制皂及工业油用，如油料植物山胡椒（Lindera glauca）；不少种类富含芳香油，可制香料及药用，如中草药三桠乌药（Lindera obtusiloba）；一些种类的木材有香气，可供家具及文体用品等用，如缅甸著名木材黄金樟的树种山香果（Lindera metcalfiana）。然而，目前对于山胡椒属的物种界定是否合适尚存争议，尤