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Science:利用蛋白系统的多尺度图谱解释癌症突变

2021年10月1日讯/生物谷BIOON/---肿瘤基因组测序显示,除了少数常见的突变基因外,影响癌症基因组的大多数突变是罕见的。为了解释这些罕见的事件,一种强有力的方法是根据突变对常见的失去调节的细胞系统的影响来梳理突变。以这种方式理解癌症基因组需要克服两个挑战:(i)如何全面地绘制癌细胞系统?(ii)如何确定哪些系统处于突变选择之下?为了解决这些问题,来

2021-10-01

Science:头颈鳞状细胞癌的蛋白网络图谱可揭示PIK3CA突变体的药物敏感性

为了描述HNSCC的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)景观,来自美国加州大学圣地亚哥分校和加州大学旧金山分校的研究人员根据对HNSCC肿瘤进行的癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)分析所确定的分子通路改变来选择蛋白。另外的蛋白是根据存在复发性点突变的基因或以前发表的与HNSCC有关的基因添加的。

2021-10-01

:黄超兰与高福团队描绘新冠刺突蛋白糖基化图谱, 揭示“O-Follow-N”糖基化新规律

  蛋白质糖基化修饰是生物体内最重要的翻译后修饰之一,发生在细胞50%-70%的蛋白上。病毒囊膜蛋白的糖基化修饰具有广泛的功能,包括调控蛋白质稳定性、病毒的趋向性、和保护潜在的抗原表位免受免疫监视等。深入了解新型冠状病毒(SARS-CoV-2)刺突蛋白(Spike, S)的糖基化修饰对于新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发病机制的探索,

2021-08-05

能抗癌、抗感染,还能让“造人”更顺利,血液中的这种蛋白厉害了!

 白蛋白(Alb)是人体血浆中最主要的蛋白质,占血浆总蛋白的40%-60%,它能有效维持机体营养和渗透压,与人类的健康密切相关。近日,来自加州大学领导的一项新研究发现,白蛋白通过激活人体内广泛存在的人电压门控质子通道(hHv1),不仅有利于精子受精,还能使白细胞大量分泌炎症介质对抗感染。相关研究结果以Direct activation of the

2021-07-19

血液中部分蛋白质水平异常或有助预测阿尔茨海默病风险

美国研究人员开展的一项新研究发现,阿尔茨海默病发病风险与血液中数十种蛋白质水平异常有关,而这种异常提前数年已开始出现。新发现为开发阿尔茨海默病预防性疗法提供了思路。美国约翰斯·霍普金斯-布隆伯格公共卫生学院近日发布公报说,这项新研究使用了美国一项持续数十年的大型研究采集和存储的血液样本。研究人员首先分析了2011年至2013年间采集的4800名中老年受试者的

2021-06-27

阻止认知及听力衰退,Plo Bio新文给出新思路:血液中的这种蛋白质是关键

  随着年龄的增长,我们的认知能力及听力水平会下降,然而在一部分人群中,认知及听力的衰退往往更加严重。究竟是什么导致了这种差异?我们能否阻止或减缓随年龄而来的大脑及听觉功能退化?近日,美国德克萨斯大学麦戈文医学院带来的一项研究报告从分子机制上为人们了解影响衰老程度的关键因子提供了新的思路。文章指出,血液红细胞中一种被称为腺苷A2B受体(A

2021-06-29

Genome research:孙良丹教授团队绘制首个中国人群蛋白截断突变图谱并揭示其对银屑病发病机制的重要影响

  6月21日,安徽医科大学第一附属医院皮肤科,安徽医科大学皮肤病研究所和皮肤病学教育部重点实验室孙良丹教授团队在国际著名学术期刊Genome research(IF:11.1)发表了题为“Deep sequencing of 1,320 genes reveals the landscape of protein-truncating

2021-06-22

Nature:构建骨髓图谱,为利用血液类器官产生血细胞开辟了道路

2021年2月15日讯/生物谷BIOON/---想象一下,有一天,治疗白血病或多发性骨髓瘤等血液病患者的临床医生可以向实验室发出请求,定制生产特定类型的血细胞,以替代受疾病影响的血细胞。在一项新的研究中,来自美国辛辛那提儿童医院的研究人员针对骨髓组织如何起作用提供了强有力的新见解。这一研究使得这一天离现实又近了一步。相关研究结果于2021年2月10日在线发表

2021-02-15

Science:利用基因相互作用图谱确定蛋白复合物的整体结构

2020年12月15日讯/生物谷BIOON/---生物学家最令人烦恼的任务之一是弄清楚蛋白---这些承担细胞工作重任的分子---是如何完成它们的工作的。每种蛋白的表面都有各种旋钮、褶皱和裂缝,决定了它能做什么。科学家们可以相当容易地在单个蛋白上可视化观察这些特征。但蛋白并不是单独行动的,科学家们还需要知道蛋白在一起工作时形成的复合物的形状和组成--他们称之为

2020-12-15

研究揭示组蛋白去乙酰化酶复合体调控光形态建成新机制

植物基因在光形态建成中会发生转录的重编程,同时伴随染色质的动态变化和组蛋白修饰的动态分布。大量光响应基因由于染色质开放性的变化,在“开(激活)”和“关(抑制)”之间切换以确保植物适应不断变化的光照环境,这些基因包含光信号途径中的重要组分因子。虽同为光信号的正向调节因子,转录因子编码基因HY5和BBX22被光诱导,光受体编码基因PHYA在光照条件下则被抑制。然

2020-12-06