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David Baker团队开发新型AI蛋白设计模型——LigandMPNN,实现原子上下文条件蛋白序列设计

研究团队开发了一种新型深度学习方法——LigandMPNN,该方法明确地对生物分子系统中的所有非蛋白质成分进行了建模。

2025-04-01

研究发现NLR蛋白免疫信号新通路

该研究揭示了PIBP4-Rab5a转运机器参与调控NLR蛋白PigmR在细胞膜微区的积累,且PigmR蛋白能够激活微区上的OsRac1蛋白,促进活性氧产生,以增强水稻对稻瘟病的抗性新机制。

2025-01-02

研究人员构建SAM关键homeobox基因调控网络解析玉米株高发育的分子机制

为构建组织特异性动态调控网络,基于黄化幼苗叶片ATAC-seq和tsCUT&Tag数据,团队设计并训练了一个机器学习模型,以预测SAM组织的调控位点。

2024-10-12

中国科学技术大学最新Nature论文:张凯铭团队等首次解析RNA结构中的复杂水网络

该研究首次系统揭示了 RNA 内部水网络的复杂性与动态性,为理解 RNA 折叠、催化及溶剂效应提供了原子级视角。

2025-03-15

Nature :抗CRISPR蛋白Acrs新发现,或源起病毒cas同源蛋白

本研究为Acrs蛋白的起源和演化提供了新的视角,提供了Acrs起源于病毒cas的直接证据,也为基因编辑技术活性调控提供了新的潜在工具。

2024-10-08

Alzheimers Dement:基于网络的分析揭示了阿尔茨海默病中引起神经炎症的小胶质细胞如何形成

该团队在阿尔茨海默病患者的小胶质细胞培养皿实验中验证了他们的计算预测,他们在实验中表明酮咯酸阻断了一种称为I型干扰素(IFN)信号传导的免疫过程。

2024-12-27

Cell:AI时代的蛋白质从头设计

该文章讨论了基于物理学的建模方法和人工智能(AI)相结合的背景下,蛋白质从头设计领域的当前状态。

2024-12-26

河南大学开发基于纳米颗粒的靶向蛋白降解通用策略,有望颠覆靶向蛋白降解工具研发格局

该研究表明利用配体修饰的纳米颗粒运输足以劫持细胞外的目标蛋白并将其靶向转运到自噬溶酶体,从而实现蛋白靶向降解,进而提出了基于纳米颗粒的靶向蛋白降解(TPD-NP)通用策略。

2024-11-05

Nat Commun :哺乳动物活细胞内可编程重构RNA调控网络的人工基因线路

研究团队首次将原本不可检测的单点突变RNA感应由1.5倍提升至94倍。由此,成功实现单碱基突变的检测,也将RNA表达量的感应扩展至序列变化的感应,极大地丰富了RNA-IN模块的识别范围。

2024-11-02

G蛋白偶联受体动态激活机制研究获进展

该研究揭示了受体构象变化的时序/动态过程,突破了传统“两态模型(非激活/激活)”的理论框架,发现了毒蕈碱型乙酰胆碱受体激活存在多步骤动态路径的重要特征。

2025-03-29