Cell Death & Disease：蛋白相互作用影响细胞存活与增殖
细胞凋亡是人类细胞对DNA损伤、新陈代谢失衡和饥饿等压力做出的反应。当无法修复这些压力时，细胞就会诱发程序性细胞死亡，称为细胞凋亡。
科学家开发一种新方法预测蛋白质与环境间的相互作用
众所周知，蛋白质是生命的基石，在所有的生物过程中发挥着关键的作用。因此，了解它们如何与环境相互作用，对于开发有效的治疗方法和设计人工细胞的基础至关重要。近日，由瑞士联邦理工学院（EPFL）生物工程研究所蛋白质设计与免疫工程实验室(LPDI)与USI信息学院计算科学研究所、英国帝国理工学院等单位合作，开发了一种突破性的机器学习驱动技术，用于预测蛋白
JCIM：计算提升蛋白质-蛋白质相互作用的预测精度
蛋白质-蛋白质相互作用和识别在生物学过程中有着非常重要的作用。尽管结构生物学已经取得了较大的进展，但直接采用实验方法确定蛋白质-蛋白质复合物结构仍然非常困难。分子对接技术是预测蛋白质-蛋白质复合物结构的有效方法。蛋白质-小分子之间的相互作用一般蛋白质受体有结合口袋，相互作用区域比较明确，而蛋白质-蛋白质相互作用则有可能发生在两个蛋白质表面上任何区域。因此，蛋白质-蛋白质相互作用的预测，需要对蛋白质
活细胞中蛋白质相互作用研究取得进展
近日，中国科学院上海药物研究所陈小华课题组和中国科学院成都生物研究所唐卓课题组合作，基于开发新的非天然氨基酸，发展了一种能够在活细胞中捕捉蛋白质相互作用的新技术，该方法兼具时空可分辨和交联位点选择性的优势。研究成果“Genetically Encoded Residue-Selective Photo-Crosslinker to Capture Protein-Protein Interacti
Cell：系统性构建出病毒与人类宿主之间的蛋白-蛋白相互作用图谱
2019年9月7日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国哥伦比亚大学的研究人员利用一种计算方法绘制出所有已知感染人类的病毒与它们感染的宿主细胞之间的蛋白-蛋白相互作用图谱。这种方法及其产生的数据已给出了大量关于病毒如何操纵它们感染的宿主细胞和引起疾病的信息。这项研究的发现包括雌激素受体在调节寨卡病毒感染中的作用和人乳头瘤病毒（HPV）如何导致癌症。相关研究结果于2019年8月29日
美国科学院院士庄小威团队开拓测量DNA与蛋白质相互作用新技术
许多基因组处理反应，包括转录、复制和修复，都会产生DNA旋转。直接测量DNA旋转的方法，如转子珠跟踪、角度光学捕获和磁性镊子，有助于揭示一系列基因组加工酶的作用机制，包括RNA聚合酶（RNAP），gyrase，病毒DNA包装机器和DNA重组酶。尽管旋转测量有可能改变我们对基因组处理反应的理解，但测量DNA旋转仍然是一项艰巨的任务。现有方法的时间分辨率不足以跟踪在生理条件下由
Science：利用基因共同进化揭示蛋白相互作用网络
2019年7月14日讯/生物谷BIOON/---对基因组进行测序变得越来越便宜，但是对所产生的数据的理解仍然很难。如今，在一项新的研究中，来自美国华盛顿大学和哈佛大学的研究人员找到了一种从已被测序的DNA中提取有用信息的新方法。通过对细菌中成对基因之间共享的细微进化特征进行编目，他们够发现数百种之前未知的蛋白相互作用。这种方法当前正应用于人类基因组，并且可能产生关于人类蛋白如何相互作用的新见解。相
Cell Rep：研究揭示与阿尔茨海默氏症相关的蛋白-基因相互作用图谱
2019年8月3日讯 /生物谷BIOON /——在诊断和治疗阿尔茨海默病(AD)的过程中，有一个事实是，无症状和有症状的退化性疾病患者可能有相似的神经病理学负担，但认知能力下降的速度却有显着不同。2019年7月23日发表在《Cell Reports》上的一项新的研究中， 加州大学圣地亚哥（UCSD）医学院领导的一个研究小组使用转录组学（基因表达的所有信使核糖核酸(mRNA)分子的聚集体）比较了41
Nature：中美科学家揭示钙粘蛋白介导的细胞间相互作用调节癌细胞铁死亡机制
2019年7月30日讯/生物谷BIOON/---铁死亡（ferroptosis）是一种由细胞代谢和铁依赖性脂质过氧化作用驱动的细胞死亡过程。它与缺血性器官损伤和癌症等疾病有关。谷胱甘肽过氧化物酶4（GPX4）是铁死亡的一种至关重要的调节剂，通过中和脂质过氧化物来保护细胞，其中脂质过氧化物是细胞代谢的副产物。直接抑制GPX4，或通过剔除它的底物谷胱甘肽或用于产生谷胱甘肽的前体分子（比如半胱氨酸）间接
纳米银与蛋白质相互作用研究取得进展
纳米银（Silver nanoparticles）是空间三个维度都处于1-100 nm范围内由银原子构成的具有特殊性质的材料，由于具有卓越的抗菌性能，被广泛用于人类生产生活的各个领域。然而，随着纳米银使用的增加，越来越多的纳米银释放到环境中，由此可能会对生物体造成毒害，从而破坏生态系统的结构和功能，进而对人类的健康造成危害。尽管目前对于纳米银的毒性是来自其释放的银离子还是纳米颗粒本身存在很大的争议