全基因组测序揭示番石榴维生素C合成和果实软化遗传基础
番石榴(Psidium guajava)是桃金娘科的重要果树,主要产于美洲和亚洲热带及亚热带地区。它因适应性强、容易栽培,产量高,且富含维生素C(抗坏血酸)等营养物质而广受欢迎,被誉为“热带苹果”。番石榴果实是重要的天然维生素C来源,但其维生素C合成的遗传基础却少有研究。桃金娘科是植物果实类型演化研究的重要模式,兼有肉质的
Nat Methods:科学家开发出了一种新方法 或能使便携式PCR测序仪达到近乎完美的准确性
2021年1月18日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中,来自英属哥伦比亚大学等机构的科学家们通过研究发现了一种简单的方法,能够消除广泛使用的便携式DNA测序仪所产生的几乎所有测序错误,从而就能帮助在实验室外工作的科学家们更加有效地研究并追踪SARS-CoV-2等病原微生物。使用特殊的分子标记,研
Nat Med:单细胞测序揭示胃癌患者差异化结局的原因
德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员对来自腹膜癌(一种特定形式的转移性胃癌)患者的45,000多个细胞进行了分析,确定了广泛的细胞异质性,并确定了与患者生存相关的两种不同亚型。
中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法,并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组
三代测序技术(PacBio和Oxford Nanopore)可解决基因组重复区域的组装难题,提高基因组完整性,已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中,纳米孔(Nanopore)测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低,并且由于其可实现超长读长(高达1Mbp),在复杂基因组组装中具有天然优势。然
华大智造基因测序仪助力我国发现首例境外变种新冠毒株
近日,中国疾控中心周刊(China CDC Weekly)在最新一期刊登的文章中称,2020年12月14日,我国海关实验室监测到一名坐飞机从境外返回的23岁女性新冠感染者,通过检测发现,该病例感染了新变种的新冠毒株。值得一提的是,此次助力发现我国首例境外变种新冠毒株的测序平台是华大智造自主研发的一款小巧灵活、性能强劲的高通量测序仪——MGISEQ
科学家利用纳米孔测序同时获取染色质可及性和甲基化信息
近年来随着DNA测序技术的蓬勃发展,蛋白质结合位点的高通量鉴定、染色质可及性及甲基化状态分析等检测技术不断涌现,其中很多技术(如DNase-seq和ATAC-seq等)依赖于开放性染色质对转座酶等的敏感性。在这些新技术中,全基因组核小体定位及DNA甲基化组测序技术(NOMe-seq)能够利用外源性M. CviPI GpC甲基转移酶标记基因组可及性
超高分辨率荧光显微技术前沿与生物学应用
超高分辨率荧光显微成像可以说是近二十年来新兴的一项革命性技术,此前光学显微镜的分辨率只能达到200纳米,被称为阿贝衍射极限,而通常病毒和亚细胞结构的尺寸只有几十到200多纳米。超高分辨显微技术的诞生突破了这个极限,使得显微成像分辨率进入振奋人心的纳米级别时代,对于精细结构的研究得到了强力的技术支持。目前商业化比较常见的超高分辨荧光显微技术主要包括受激发射耗损
纳米孔测序成为基因测序蓝海
齐碳科技宣布完成4000万元的第三轮融资,领投方为中关村协同创新基金、雅惠精准医疗基金,百度风投继续跟投。本轮资金将全部用于新一代纳米孔基因测序仪的技术研发,计划于2020年1月研发出最小可行化产品。齐碳科技的纳米孔基因测序属于第四代测序技术。与前代测序技术相比,它的特点是利用电信号实现单分子测序,不需要进行PCR扩增。这种测序方式的优势非常显着
内蒙古满洲里两例病例样本病毒基因测序结果公布
11月26日,内蒙古自治区新冠肺炎疫情防控指挥部召开新闻发布会,通报了满洲里市包某某、孙某某两例病例基因测序的结果。在确诊了包某某、孙某某为本土病例后,内蒙古自治区综合疾病预防控制中心专家到呼伦贝尔市疾病预防控制中心开展基因测序,对确诊包某某和孙某某两例病例进行基因测序,全基因组测序结果显示,本次内蒙古满洲里市的病例新冠病毒属于L基因型欧洲家系分支I(B.1
研究完成海湾扇贝两个亚种的基因组测序和组装
日前,青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展,海洋科学与工程学院王春德教授课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组的测序和分析,相关研究成果在线发表在Nature旗下开源期刊Scientific Data上。此前,王春德课题组已完成紫扇贝基因组的测序和组装,紫扇贝和海湾扇贝两个亚种基因组的成功测序,为从分子水平解析海湾扇贝