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Advanced Science:韩敬东团队开发转录数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

Cell:开发新型邻近蛋白质学技术,第一作者秦为已回国加盟清华大学

大城市内的地铁线路错综复杂,每天不同的人会从一个站点通勤到另一个站点,承担着自己的社会责任。细胞内的蛋白质在时间和空间等维度上也是高度动态的,很多蛋白会在不同的细胞器之间甚至是不同的细胞之间进行转运和

2023-07-03

港大团队对32万余人开展分析发现,二甲双胍可通过GDP1和AMPKγ2促进健康衰老

GPD1诱导的HbA1c降低与较年轻的表型年龄、较长的白细胞端粒长度有关;AMPKγ2诱导的HbA1c与较年轻的表型年龄有关,但与白细胞端粒长度无关。

2023-08-08

藏野驴肠道菌群宏基因研究获进展

迁地保护是除就地保护之外对濒危野生动物保护的另一种主要方式。动物园作为迁地保护的重要场所,属于典型的人工圈养环境。在该环境中,人工对圈舍消毒灭菌,为动物提供丰富的食物,也会使用抗生素治疗一些疾病。

2023-06-13

单细胞多组学技术揭示三维基因与基因表达的关系

在高等真核生物中,基因组在细胞核内的三维空间构象对细胞功能至关重要。例如,增强子常常通过三维空间相互作用对远端目的基因的转录活性起调控作用

2023-06-21

Nature:对1万多份人类癌症样本分析揭示了染色体失衡驱动癌症发生背后的分子机制

来自MIT等机构的科学家们通过利用所开发的计算工具进行研究后发现,非整倍体会驱动癌症的进展;利用这种方法,研究人员比价了1万多名癌症患者机体肿瘤细胞的大型染色体改变,并识别出了关键的染色体区域。

2023-07-07

科研人员揭示基因古病毒复活驱动脑衰老

该研究首次系统地解析了灵长类额叶衰老伴随的组织转录组、单核转录组、蛋白质组及全基因组DNA甲基化层次的多维改变,进而,利用神经病理学检测体系和体外人类神经元衰老模型,提出核纤层(Nuclear lam

2023-06-08

张锋团队在动物身上发现了新的类似CRISPR/Cas的系统,可以编辑人类基因

在一项新的研究中,美国布罗德研究所以及麻省理工学院麦戈文大脑研究所的张锋(Feng Zhang)教授领导的一个研究团队发现了包括真菌、植物和动物在内的真核生物中第一个可编程的RNA引导系统。该团队描述

2023-07-03

科学家开发出用于肝癌特异性筛查的全基因cfDNA片段化特征检测方法

肝癌的发病率和死亡率在癌症中位居前列,全世界每年新增病例超过90万,死亡病例超80万。在所有肝癌病例中,肝细胞癌 (HCC)占比约90%,对肝细胞癌高危人群进行有效、高灵敏度的筛查显得尤为重要。目前对

2023-06-25

空间转录数据多模态可视化工具研究取得进展

目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。

2023-06-05