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PLoS Pathog:基因角度深入解析病原菌致病的分子机制

2012年9月17日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在著名杂志PLoS Pathogens上的研究报告“Insights from Genomics into Bacterial Pathogen Populations”中,来自牛津大学人类遗传学中心的研究者从基因组学角度来深入剖析了致病菌的致病机制。 每年由于致病菌的感染、致病甚至死亡给全人类带来了巨大的精神和经济负担。

2012-09-18

昆明植物所利用第二代高通量测序仪首次解析麻竹花转录

中国科学院昆明植物研究所郭振华研究组和李德铢研究组多年来致力于竹子的繁殖和开花机理研究。最近,利用高通量的Illumina GAII测序平台,研究人员对木本竹种麻竹(Dendrocalamus latiflorus)不同发育时期的花组织进行了转录组测序。测序共产生了约96,000,000个reads,经de novo从头组装后共得到了146,395个高质量的unigene,平均长度为461 bp。

2012-11-19

Proteomics:种子萌发蛋白质研究获进展

水稻种子萌发的代谢途径 种子萌发是种子植物生长发育过程中的早期阶段,是个体发育中最为关键的时期,直接影响到后期的出苗、生长和结实等。种子萌发涉及到细胞膜系统修复、贮藏物代谢、DNA复制与配对等一系列复杂的生理生化反应和信号传导,对这一生理过程的分子机制进行探讨,一直是现代种子生物学研究的重要课题。

2011-11-22

Nat Biote:华大基因揭示人转录中存在大量的RNA编辑

近日,来自深圳华大基因研究院和台湾长庚大学的研究人员研发了一种对人类转录组中的RNA编辑位点进行测定和分析的新型计算方法,并发现人类转录组中存在大量的RNA编辑现象,该成果于2012年2月12日在国际著名杂志《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)上在线发表。

2012-11-18

Nat Commun:鸟类适应青藏高原特殊环境的基因证据

地山雀(Parushumilis)是青藏高原的特有鸟种,属山雀科鸟类。由于其形态特征与地鸦相近,曾长期被认为是鸦科鸟类,并被命名为“褐背拟地鸦”。 中科院动物研究所动物进化与系统学院重点实验室雷富民研究员领导的鸟类学研究组与诺禾致源合作,对地山雀开展全基因组denovo测序,同时对另外两种山雀(大山雀和黄颊山雀)以及黑尾地鸦进行了重测序比较分析。

2013-07-22

Proteomics:杨平仿等研究种子萌发蛋白质获进展

水稻种子萌发的代谢途径 种子萌发是种子植物生长发育过程中的早期阶段,是个体发育中最为关键的时期,直接影响到后期的出苗、生长和结实等。种子萌发涉及到细胞膜系统修复、贮藏物代谢、DNA复制与配对等一系列复杂的生理生化反应和信号传导,对这一生理过程的分子机制进行探讨,一直是现代种子生物学研究的重要课题。

2011-11-23

基因编辑工具新星---转录激活子样效应因子核酸酶(TALEN)

TALE第171位Ser删除后的三维构象模型也显现出非常类似的球状结构,图片篇来自Biochemical Journal, 2004, 382: 725-731. 2011年6月,位于美国加利福尼亚州卡尔斯巴德市的生命科技公司(Life Technologies)获得美国伊利诺斯州埃文斯顿市双刀片基金会(Two Blades Foundation)和德国哈雷市马丁-路德大学一组植物学家的独占性许

2012-11-18

PBJ:花生转录de novo测序揭示果针发育相关的功能基因

近日,由广东省农业科学院作物研究所梁炫强研究员、陈小平博士,山东省农业科学院花生研究所所长禹山林研究员及国际半干旱热带作物研究所(ICRISAT)基因组中心负责人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生转录组de novo测序的结果发表于Plant Biotechnology Journal。该杂志创刊于2003年,影响因子5.44,是专注于应用植物科学的期刊。

2013-01-04

Genome Biol:新型转录技术或可加速对组织再生机制的理解

2013年2月20日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,来自马克斯普朗克研究院的研究者通过研究鉴别出了在水螈组织再生过程中所表达的蛋白质家族,这或许为深入研究是否一系列基因可以被进行特定目的的研究提供基础,相关研究刊登于近日的国际杂志Genome Biology上,水螈的转录组及所有的RNA分子图谱也刊登于这期杂志上了。

2013-02-21

PLoS ONE:转录断层技术可对脑部疾病的基因表达进行三维成像

2013年1月12日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,来自日本一个研究小组开发出了一种新型技术,可以对大脑结构中的基因表达样式进行三维成像,这种技术俗称为转录组断层技术,其结合了组织切片的微阵列技术,可以都对脑部基因表达的密度和位置进行精确图谱成像,相比当前的绘图成像技术,这种新型技术具有较高的分辨率,相关研究成果发表于国际杂志PLoS ONE上。

2013-01-14