空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。
2024-07-02
Cell Stem Cell丨Ivan Bedzhov 课题组揭示胚胎滞育调控新机制
本研究揭示了滞育胚胎在转录水平上是动态变化的。此外,上胚层细胞依靠Integrin感知外部微环境,并通过 Yap/Taz 介导的促生存信号来维持在滞育期间的存活。
2024-08-03
PNAS:傅雄飞团队揭示生物“迁徙淘汰”病毒新机制
普遍观点认为,宿主的运动会加速病毒的传播。但也有生态学研究表明,宿主的运动对病毒传播起到抑制作用,北美帝王蝶就是一个典型例证。观察显示,那些进行长距离迁徙的帝王蝶相较于不迁徙的同类,感染寄生虫病的风险
2024-12-20
Cell Metabolism | 营养素影响胰岛素分泌的蛋白质组学密码
这项研究在人胰岛中确定了碳水化合物、蛋白质和脂质三种营养素的胰岛素分泌反应,搭建了在线数据平台:www.humanlislands.com作为胰岛深层表型网络资源。
2024-08-12
Gut Micro:肠道微生物组或会影响免疫细胞在机体中所处的位置
本文研究强调了肠道免疫细胞和微生物组组成的局部区域差异,并识别出了易受微生物存在影响的免疫细胞亚群,相关研究结果或为理解疾病模型中免疫细胞的改变提供了新的线索和思路。
2024-09-24
BBI:揭示小鼠机体微生物组和攻击性行为之间的神秘关联
本文研究揭示了肠道微生物组在调节机体攻击性行为上所扮演的关键角色,并强调了其背后潜在的作用途径,从而就为开发针对攻击性行为相关障碍的新型治疗性策略提供了新的见解。
2024-10-07
Nature Methods :核苷酸转换模型(Nucleotide Transformer, NT)——解锁基因组预测的新纪元
该模型不仅能像阅读文本一样解读DNA序列,还能够预测基因组中的关键功能区域。
2024-12-12
Cell:转座子——基因组中的“垃圾”如何化身为免疫调控的利器?
IFNAR2-S的出现无疑是基因组进化的一次神来之笔,它不仅丰富了灵长类动物的免疫调控能力,也提醒我们:基因组中的“小插曲”,常常孕育着伟大的生物学创新。
2024-12-22