Briefings in Bioinformatics：发表多表型全基因组关联分析方法研究成果
近日，上海交通大学生命科学技术学院生物信息学与生物统计学系、上海交大-耶鲁生物统计与数据科学联合中心团队在《Briefings in Bioinformatics》（IF： 11.622）上发表题为“GESLM algorithm for detecting causal SNPs in GWAS with multiple phen
Oncogene：揭示胃肝样腺癌的基因组学特征和潜在治疗靶点
胃肝样腺癌（Hepatoid adenocarcinoma of the stomach， HAS）是临床上一种非常罕见，但恶性程度很高的胃部肿瘤。该肿瘤侵袭性极强，患者易出现肝脏和淋巴结的转移，患者预后极差。此肿瘤最早于1985年由日本学者所报道，因在组织形态学上能同时观察到胃腺癌及肝细胞肝癌特征故而得名。此外，此肿瘤高
Journal of Genetics and Genomics：利用基因组编辑技术提高小麦氮素利用效率和产量
小麦为全球人口提供主粮，小麦增产可缓解人口增长带来的粮食危机。氮元素作为植物生长发育所必需的一类营养元素，是制约农作物产量的重要因素。对作物氮素利用关键调控基因进行靶向编辑，是改良作物产量的有效策略。前期研究发现，水稻ARE1基因是调控氮素利用效率和产量的关键基因。ARE1基因在植物中高度保守，研究人员推测，对其他作物中ARE1基因的
小麦基因组编辑递送系统研究获进展
植物基因编辑的一个关键步骤是将Cas9蛋白和sgRNA递送到植物细胞中发挥作用，目前植物中的递送方式主要有农杆菌和基因枪转化两种，均需要通过较长时间的组织培养和再生才能够获得完整的突变体植株。然而，组织培养和再生仍是植物基因编辑的限速步骤，对于一些单子叶植物，尤其是对于包含庞大且复杂的六倍体基因组的普通小麦，其基因组编辑尤为困难。开发
用生命“赌”病因，全基因组测序是否能终结求医苦旅？
世界上有近7000种罕见病，约80%罕见病是源于基因缺陷导致的遗传病。但由于人类基因组含有约30亿对碱基对，造成由基因缺陷导致的罕见病不仅种类繁多，还很少见，大部分医生们很难有相关诊断经验，导致罕见病人的诊断之路充满迷雾般的坎坷。有数据显示，全球每个罕见病患者平均看过8个医生、有过3次误诊经历、平均确诊时间长达7年多。
大豆基因组解析研究取得进展
中国科学院东北地理与农业生态研究所研究员冯献忠课题组等选择1份东北野生大豆、7份我国代表性栽培种，结合平均50×的三代测序和Hi-C测序，组装了高质量大豆参考基因组。组装的8个大豆基因组大小范围为986.1-1001.3Mb，Contig N50=1.4-6.1Mb，BUSCO完整性评估为96.7%-97.3%；结合同源注释、从头注释
现代人仅7%基因组不同于其他早期人类
究竟什么让智人与众不同，进化成为如今的现代人？美国一项研究显示，答案可能存在于仅占人类基因组7%的特有遗传物质。据美联社17日报道，加利福尼亚大学圣克鲁斯分校研究人员比较现代人的基因与已经灭绝的其他人类基因得出上述结论，研究报告刊载于最新出版的美国《科学进展》杂志。研究涉及的基因样本来自世界各地的279人，以及从尼安德特人和丹尼索瓦人
首次揭示蛋白BANP与基因组的CGCG基序结合，从而激活必需基因表达
2021年7月19日讯/生物谷BIOON/---称为转录因子的蛋白质作为开关，调节附近基因的表达，但是这些基因开关的一些身份迄今仍然是神秘的。如今，瑞士弗雷德里克-米歇尔生物医学研究所的Dirk Schübeler博士及其团队鉴定出一种新的开关，它可以调控小鼠和人类基因组中的必需基因。识别缺失的基因开关及其功能对于全面了解健康和疾病的分子基础至关重要。相关研
Nature Communications：百岁兰基因组和适应性进化机制研究取得进展
百岁兰（Welwitschia mirabilis）又名千岁兰，是买麻藤类单种科百岁兰科孑遗植物，系裸子植物中唯一的草状木本，是罕见的植物。化石记录百岁兰曾广泛分布在巴西、葡萄牙等地。随着大陆板块分裂，气候骤变，自然居群幸存于如今的安哥拉与纳米比亚沙漠。百岁兰是《濒危野生动植物种国际贸易公约》（CITES）附录Ⅱ保护植物，被国际植物学会列为世界八大珍稀植物之