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南京农大构建世界首个植物重复基因数据库

 2月21日,南京农业大学园艺学院教授张绍铃团队在国际著名学术期刊Genome Biology在线发表研究论文,系统鉴定了梨等141种植物基因组中不同类型重复基因,构建世界首个植物重复基因数据库,揭示重复基因进化的普遍规律。植物在千百年的进化中,怎样变得越来越多姿多彩?一个重要因素就是植物会复制自己基因,丰富自己的基因库数量。团结起来力量大,多了自己的“同胞胎”兄弟姐妹,基因在生物体中就

2019-02-25

汇集上万BRCA基因突变信息 美国国家癌症研究所启动BRCA数据库

 日前,美国国家癌症研究所(NCI)宣布启动BRCA Exchange。这是一个汇集了全球成千上万个遗传性BRCA1和BRCA2基因变异信息的数据库。大众可以通过一个网站和一款智能手机App来获取数据库中的信息。这一数据资源让临床医生们可以参考专家们对不同BRCA基因变异与癌症关系的评估,从而对解决与癌症预防、筛查和干预相关的多种复杂问题进行指导。BRCA基因是影响癌症风险的重要基因之一

2019-01-22

Science:如今是时候建立一个通用的遗传数据库吗?

2018年12月2日/生物谷BIOON/---美国范德堡大学大学的一个研究团队在2018年11月23日的Science期刊上发表的一篇标题为“Is it time for a universal genetic forensic database?”的政策论坛(Policy Forum)类型文章中认为,也许是时候开始建立一个通用的遗传数据库了。他们认为这样做将有助于执法人员追查犯罪分子。图片来自C

2018-12-02

北京基因组所开发系列特色科学数据库

近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas、犬类数据库iDog、RNA编辑与疾病相关知识库EDK、植物RNA编辑数据库PED、人类长非编码RNA数

2018-11-11

研究人员开发长非编码RNA数据库LncBook

近日,由中国科学院北京基因组研究所开发的人类长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)数据库LncBook正式上线。该项研究成果以LncBook: a curated knowledgebase of human long non-coding RNAs 为题在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。近年来,有关lncRNA的

2018-11-03

Nature:发现最大白血病数据库 辅助治疗药物的最优选

 历经多年研究,科学家们发布了一个庞大的数据集,详细描述了500多名患有急性髓细胞性白血病(Acute myeloid leukemia,AML)患者肿瘤细胞的分子组成。该数据集包括数百个个体患者的细胞如何在实验室中对一系列药物做出反应,为日后对于AML的研究进一步打下基础。10月17日,《Nature》杂志以“Functional genomic landscape of acute

2018-10-19

Nature:推出小鼠细胞的开源数据库---Tabula Muris

2018年10月5日/生物谷BIOON/---来自美国斯坦福大学、陈-扎克伯格生物中心(Chan Zuckerberg Biohub),弗吉尼亚州帕洛阿尔托医疗保健系统和加州大学的一个庞大的研究团队组建了一个名为Tabula Muris的小鼠细胞信息的开源数据库(网址:https://tabula-muris.ds.czbiohub.org/)。在他们发表在Nature期刊上的标题为“Single

2018-10-05

两篇Nature论文聚焦英国生物样本中的基因组和表型数据

2018年10月13日/生物谷BIOON/---两个研究团队独立地在Nature期刊上发表两篇论文,描述了使用英国生物样本库(UK Biobank)中的全套数据开展的研究。第一个研究团队由来自英国、澳大利亚和瑞士的研究人员组成---他们搜索了英国生物样本库,从中寻找遗传变异和表型之间的关联性,以便填补这些数据中的空白。第二个研究团队由牛津大学的研究人员组成---他们使用英国生物样本库旨在将遗传数据

2018-10-13

升级版环形RNA数据库网站发布

  近日,国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康院)中科院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCpedia v2: An Updated Database for Comprehensive Circular RNA Annotati

2018-09-20

中国卫生信息与健康医疗大数据学会细胞生物产业化专委会成立大会在沪隆重召开

2018年7月13日,国家卫健委直属中国卫生信息与健康医疗大数据学会细胞生物产业化专委会成立大会在上海隆重召开。该专委会是由原能细胞科技集团、上海健康医学院、上海市东方医院、上海市长征医院、中源协和细胞基因工程股份有限公司、方正科技集团有限公司、上海细胞治疗工程技术研究中心、上海张江生物医院基地开发有限公司、三胞生物科技有限公司、赛默飞世尔科技(中国)有限公司、青岛海尔特种电器有限公司、上海市细胞

2018-07-17