中国科学家揭示乙肝病毒相关性肝癌的多维蛋白基因组学特征
肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)是全球第四大癌症死亡原因,占所有原发性肝脏恶性肿瘤的85%-90%。HCC诱发的主要原因包括乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)和丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)慢性感染、酗酒以及代谢综合征。其中,85%的中国HCC患者是由HBV感
安捷伦基因组学系列讲座 —— 超长片段 DNA 样本分离与质控的终极解决方案
脉冲场电泳可以分离几十 Kb 的超长片段 DNA,然而传统的脉冲场电泳动辄就要运行过夜,实验结果还受诸多外界因素影响。当样本量很大,时间是个关键因素时,该如何解决?本次讲座,我们将向您系统阐述脉冲场电泳的基本原理,您将了解到最先进的十倍于传统脉冲场电泳速度的 Femto Pulse 全自动脉冲场电泳系统,以及 Femto Pulse 系统如何解决三代测序样本质量控制的问题。
安捷伦基因组学系列讲座:二代测序文库构建新理念
实验室样本量增加了,原先的机械打断仪不够用了,再买一台又没有预算,怎么办?样本来源过于稀有,初始样本量不足以支撑常规建库方法,怎么办?趋动基因的突变频率低,接近测序错误率,无法区分是真实突变还是系统错误,怎么办?安捷伦文库构建新方案,帮你省去机械打断仪,让用户获得更好的文库复杂性和覆盖率,解决低起始量样本建库问题,有效区分真实突变与系统错误,并实现快速文库构建。新方案,新理念,新高度。本次讲座将覆
安捷伦基因组学系列讲座:二代测序文库构建新理念
实验室样本量增加了,原先的机械打断仪不够用了,再买一台又没有预算,怎么办?样本来源过于稀有,初始样本量不足以支撑常规建库方法,怎么办?趋动基因的突变频率低,接近测序错误率,无法区分是真实突变还是系统错误,怎么办?安捷伦文库构建新方案,帮你省去机械打断仪,让用户获得更好的文库复杂性和覆盖率,解决低起始量样本建库问题,有效区分真实突变与系统错误,并实现快速文库构建。新方案,新理念,新高度。本次讲座将覆
第十四届国际基因组学大会(ICG-14)正式开幕
2019年10月25日上午,第十四届国际基因组学大会(The 14th Annual Meeting of International Conference on Genomics,以下简称“ICG-14”)在深圳国家基因库正式开幕。来自全球的顶尖科学家和创新者齐聚深圳,他们将通过主题演讲、专题研讨和成果演示的方式,与ICG-14参会者们分享他们的成果与观点。国际基因组学大会是由华大主办的全球生命
Science:利用单细胞基因组学进行人类细胞表型分析
2019年10月20日讯/生物谷BIOON/---在一篇近期发表在Science期刊上的标题为“Mapping human cell phenotypes to genotypes with single-cell genomics”的综述类型文章中,瑞士研究人员认为在了解构成人体的细胞表型和人类基因组如何被用来构建和维持每个细胞的目标中,我们正处在一个迷人的旅程中。瑞士巴塞尔分子与临床眼科研究所
宏基因组测序(mNGS):病原微生物检测新风口
基于宏基因组新一代测序技术(metagenomics next generation sequencing, mNGS) 不依赖于传统的微生物培养,直接对临床样本中的核酸进行高通量测序,能够快速、客观的检测临床样本中的多种病原微生物(包括病毒、细菌、真菌、寄生虫),尤其适用于急危重症和疑难感染的诊断。随着mNGS 技术平台的完善和临床研究的增多,mNGS在临床上的运用将越来越广泛。
Mol Bio Evo:基因组学研究揭示细菌抗生素耐药性如何在不同物种间传播
2019年9月18日 讯/生物谷BIOON/ --在最近一项研究中,来自克莱姆森大学的研究者们记录了人体内寄生菌所产生的抗生素耐药性基因向其它物种内寄生菌横向传播的趋势。每年都会有大量的人群患有各种人畜共患病,这些疾病通常通过食物,水或与动物直接接触传播,而直接导致疾病发生的病原菌则包括沙门氏菌,大肠杆菌,炭疽等。对此,研究员Richards认为,人类体内抗生素抗性基因的出现最有可能是由于过度使用
研究人员绘制肝癌药物基因组学“蓝图”
8月1日,国际学术期刊Cancer Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所惠利健研究组、中国科学院上海营养与健康研究所李亦学研究组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌研究组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷合作的题为A Pharmacogenomic Landscape in Human Liver Cancers 的研究论文。该工作报道了目前最大的肝癌细胞模型平台和最详细
6小时识别病原菌的纳米孔宏基因组学方案
近日,英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。该优化后的研究方案针对细菌性下呼吸道感染,可从临床呼吸道样本中去除高达99.99%的宿主核酸,并利用纳米孔测序的实时检测在6小时内准确识别病原体和抗生素抗性基因。《Nature Biotechnology》杂志7月以封面文章的形式刊登了该项研究。细菌性下呼吸道