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Nature 子刊:多组学数据与机器学习识别新的癌症基因

癌症基因的鉴定在精准肿瘤学和癌症治疗学的发展中起着至关重要的作用。癌症的进展被认为是由驱动基因突变的积累引起的,这些突变赋予细胞选择性的生长优势。在过去的几年里,人们致力于从遗传大数据中找出癌症基因,预测癌症基因的最初方法是寻找显着突变的基因,然而,目前已知的癌症基因(KCG)目录的完整性仍存在争议。尽管成千上万的癌症基因组序列有助于癌症基因的鉴定,但仍存在

2021-04-30

PNAS:免疫细胞如何识别并破坏真菌菌丝

天然免疫(innate immunity)为宿主免受真菌感染提供了必不可少的保护。 但是,免疫细胞和真菌病原体之间的相互作用具有复杂的结果,原因在于某些病原体发展出逃避免疫细胞识别,吞噬和杀死的机制。 例如,白色念珠菌可以通过形态变化,形成难以吞噬的长菌丝来逃避吞噬作用。在最近一项研究中,来自英国Foresterhill 医学科学研究所的Alistair J

2021-04-18

我国科学家揭示转录起始复合物识别启动子及动态组装的分子机制

    为了应对复杂的生长发育过程,以人类为代表的高等生物进化出了复杂的基因表达调控机制。转录是基因表达的第一步,是基因表达调控的主要阶段。转录起始过程发生在基因转录起始位点上游的启动子区,围绕启动子区转录起始过程的调控,是细胞体系内最为核心的生命过程之一,对其进行研究一直是生命科学的重大前沿课题。复旦大学研究团队利用

2021-04-26

eLife:识别出能将前体细胞转化为肾脏细胞的新型分子开关

2021年4月13日 讯 /生物谷BIOON/ --经典的Wnt信号通路转录共激活因子β-连环蛋白(β-catenin)能够调节哺乳动物肾元祖细胞(NPCs,nephron progenitor cells)的自我更新和分化。肾脏的发育是干祖细胞自我更新维持并扩大自身数量和其分化为更具特异性细胞类型之间的一种平衡性的动作/行为;近日,一篇发表在国际杂志eLi

2021-04-12

bioRxiv:科学家识别出一种有望治疗肺癌的新型潜在靶点

2021年4月13日 讯 /生物谷BIOON/ --在癌症研究中,个体化医学疗法往往利用了单一肿瘤中特殊的遗传改变来寻找其弱点并对其进行攻击,很多肿瘤都携带有高水平的突变,这或许是因为一种特殊的抗病毒防御机制—APOBEC系统,其能意外地损坏DNA并诱发突变。对癌症突变特征的分析常常会给研究人员提供突变来源的大量信息,并能指导临床疗法的使用,包括免疫疗法等;

2021-04-13

BMC Medicine:关于智能识别肺癌及其易混淆疾病的病理图像的深度学习研究取得进展

中山医学院李伟忠教授团队和附属第一医院柯尊富教授团队联合开发了一种基于深度学习的肺部病理图像智能诊断模型,能够准确区分肺癌及其易混淆疾病的病理图像。研究成果“Deep learning-based six-type classifier for lung cancer and mimics from histopathological whole slide

2021-04-15

Cancer Discovery:识别出有望帮助开发耐药性结直肠癌疗法的新型遗传性药物靶点

2021年4月19日 讯 /生物谷BIOON/ --结直肠癌俗称为肠癌,其是英国第四大常见的癌症类型,每年在英国都有大约42,300名个体会被确诊为结直肠癌。靶向性疗法、化疗和免疫疗法通常被用来治疗错配修复缺陷(dMMR,mismatch repair-deficient)/微卫星不稳定水平较高(MSI-H)的结直肠癌患者(CRC),然而靶向性疗法和化疗的临

2021-04-18

eLife:科学家开发出新方法来识别癌症发生过程中的突变标签

2021年4月2日 讯 /生物谷BIOON/ --确定癌症突变的原因是当代癌症研究领域科学家们所面临的基本挑战之一,不同的突变过程会诱导不同类型的DNA突变,从而就会提供相应的突变特征来帮助解析癌症的病因,在评估基因组数据时研究人员最广泛使用的特征就是基于未监督的模式,随后才能追溯到与癌症的某些特征相关。日前,一篇发表在国际杂志eLife上的研究报告中,来自

2021-04-02

Blood Cancer Dis:基于机器学习的图像分析可可靠地识别血液恶性肿瘤

骨髓增生异常综合症(MDS)是骨髓中干细胞的一种疾病,会干扰血细胞的成熟和分化。每年,大约有200名芬兰人被诊断患有MDS,可以发展为急性白血病。在全球范围内,MDS的发病率是每100,000人年4例。

2021-03-23

开发出识别癌细胞表面上蛋白抗原表达水平的CAR-T细胞,有望用于实体瘤治疗

2021年3月24日讯/生物谷BIOON/---在癌症免疫疗法中,患者自身免疫系统中的细胞被激活以攻击癌细胞。CAR-T细胞疗法是最近针对癌症的免疫疗法中最重要的进展之一。在CAR-T细胞疗法中,从患者体内提取T细胞进行基因改造:利用病毒载体将嵌合抗原受体(CAR)递送到T细胞中形成CAR-T细胞,使之更好地识别和杀死癌细胞。当CAR-T细胞在患者细胞中识别

2021-03-24