Nature:我国科学家揭示Snf2介导染色质重组的DNA滑动机制
2019年3月16日讯/生物谷BIOON/---染色质重塑剂包括多种具有不同生物学功能的酶,但是它们似乎具有一种相同的特征:核小体滑动活性。在这些染色质重塑酶中,Snf2作为研究这个蛋白家族作用的原型。Snf2和相关的酶具有两个保守的RecA样小叶,它们本身能够将ATP水解与染色质重塑偶联在一起。这些酶借助ATP水解沿着DNA滑动核小体的机制仍不清楚。在一项新的研究中,中国科学院物理研究所的李明(
CRISPR J:将Cas9与染色质调节肽进行融合,可提高CRISPR-Cas9编辑效率
2019年2月24日讯/生物谷BIOON/---通过Cas9核酸酶靶向感兴趣位点的CRISPR基因组编辑工具在效率上差异很大。在一项新的研究中,来自MilliporeSigma公司的研究人员报道一种新的称为CRISPR-chrom的染色质调节肽(chromatin-modulating peptide, CMP)融合策略可将CRISPR-Cas9的基因组编辑活性提高数倍。CRISPR-chrom是
人类原发性癌症染色质可接近性图谱揭示DNA-蛋白结合与癌症发生存在着关联
2018年10月27日/生物谷BIOON/---癌症是世界范围内死亡的主要原因之一。尽管2%的编码蛋白的人类基因组已被广泛研究,但是关于癌症中的非编码基因组(占人类基因组的98%)和基因调控,仍然有很多是未知的。通过转录因子(transcription factor, TF)作用于分散在非编码基因组中的发挥着长程影响的DNA调节元件,基因在适当的细胞类型和细胞状态中打开和关闭。癌症基因组图谱(Th
多篇文章解读染色质领域最新研究进展
本文中,小编整理了多篇研究报告,共同解读近年来科学家们在染色质研究领域取得的重要成果,与大家一起学习!【1】Science:重大进展!利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性doi:10.1126/science.aau0730不同细胞类型的基因组可能是相同的,但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成,而转录组指的
利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性
2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的,但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成,而转录组指的是在某一特定条件下,细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中,细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化,因此染色质可接近性有
首次构建出哺乳动物单细胞染色质可接近性图谱
2018年8月26日/生物谷BIOON/---科学家们对DNA缠绕和包装到所谓的染色质中的方式感兴趣,这是因为这会影响每个细胞中可用到的遗传信息。DNA就像串在一根绳子上的念珠。在这些分子“念珠”移动的地方会有空间形成,这样蛋白就能够访问和“读取”遗传信息。这种状态或者说这种基因组特征就是染色质可接近性(chromatin accessibility, 也译作染色质开放性)。在一项新的研究中,来自
研究揭示染色质修饰调控植物基因表达新机制
8月6日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室何跃辉研究组(与刘仁义研究组合作)和杜嘉木研究组(与美国威斯康辛大学钟雪花研究组合作)在《自然-遗传学》背靠背分别发表题为Polycomb-mediated gene silencing by the BAH-EMF1 complex in plants和EBS
两篇Nature首次重建出染色质重塑蛋白-核小体的三维结构
2018年4月27日/生物谷BIOON/---高等生物的基因组DNA被紧凑地包裹在细胞的细胞核中。DNA紧密地缠绕在大量的被称作核小体的组蛋白线轴上。比如,人细胞以这种方式容纳长约两米的DNA。然而,基因必须不断经过转录过程形成信使RNA(mRNA)来指导蛋白合成。此外,整个DNA在细胞分裂之前必须完成复制,而且DNA损伤也需要加以修复。因此,细胞必须有方法积极授予对它的基因组的访问权限。这正是染
Nature:测量单个细胞的染色质可接近性,从而揭示胚胎发育路径
2018年3月25日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,美国华盛顿大学和位于德国海德堡市的欧洲分子生物学实验室的研究人员证实细胞类型和发育阶段能够从数千个单细胞的染色质可接近性(chromatin accessibility, 也译作染色质开放性)测量中推导出来。他们利用这种方法发现正在发育的胚胎中的细胞如何调节它们的身份,从而决定着它们变成什么类型的细胞。相关研究结果发表在2018年3月
Mol Cancer Res:深入解读癌症的染色质疗法有望开发出新型的个体化癌症疗法
2018年2月10日 讯 /生物谷BIOON/ --很多癌症传统疗法常常会产生严重的副作用,但如今研究人员正在寻找新方法开发“靶向性制剂”,来降低药物的副作用,并且使其更好地满足每位患者的需求,近日,一项刊登在国际杂志Molecular Cancer Research上的研究报告中,来自波士顿大学医学院的研究人员通过研究阐明了如何检查某些特定的癌症抑制剂,来更好地理解细粒效应和不利效应,从而开发出