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Nature Communications:研究发表单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库

 作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断,研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释,以及综合多数据集的研究。然而,精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战:一、数据集之间的批次效应(batch effect)会显着影响细胞检索的可靠性;二、目前缺少跨物

2020-07-15

三七主要皂苷成分的生物合成途径解析和源重建方面获进展

 三七(Panax notoginseng),作为五加科药用植物,是我国复方丹参滴丸、云南白药、血塞通和片仔癀等中药品种的主要原料。迄今为止,以三七总皂苷为原料的血塞通系列品种产值每年已超过100亿元。因三七属野外灭绝物种,目前主要通过人工种植满足入药需求,但人工种植过程中也遇到品种退化严重、生长环境要求苛刻、适生区狭窄(云南文山州为道地产区)、连

2020-07-07

研究获得青鳉胚胎发育过程中的转录及调控动态图谱

 青鳉(Oryzias latipes)是一种重要的脊椎动物模型,已经在遗传学、发育生物学以及环境科学等领域广泛应用。目前,青鳉已有高质量的基因组序列,以及大量可用的遗传学技术手段。然而,目前的青鳉基因组注释主要是基于生物信息学预测和短读长的转录组测序数据,仍然存在很多问题。低质量的基因组注释是利用青鳉作为模式动物进行组学和系统生物学研究的重要障碍

2020-07-07

中国重点研发计划抗疫国际合作拟4方部署11任务

 中国科技部6日通过国家科技管理信息系统公共服务平台发布国家重点研发计划2020年度应对新冠肺炎疫情国际合作项目申报指南显示,拟在抗新冠肺炎的药物、疫苗、检测试剂、中医药等4个方向,部署11个研究任务,拟支持项目不超过37项,项目执行期不超过2年。药物方向,聚焦抗病毒药物、免疫治疗药物和抗体类药物等抗新冠肺炎药物开展联合研发,研究任务包括抗新冠肺炎

2020-07-07

专家:北京疫情防控形势趋稳好 公众应做好防护理性看待

 记者从5日举行的北京市新冠肺炎疫情防控工作新闻发布会上获悉,6月11日至7月4日北京市累计报告334例新冠肺炎确诊病例;目前病例数总体呈下降趋势,截至7月4日,已连续7天每日新增病例保持在个位数水平。专家提示,连日来北京新增病例数保持在低位,出院病例数不断增加,首都疫情防控形势持续趋稳向好;公众应理性客观看待新冠病毒,在做好个人防护的同时需要认识

2020-07-06

研究揭示脊椎动物源多倍体亚基因组演化的动态历史

 多倍化现象在脊椎动物中极为罕见;多倍体脊椎动物在多倍化发生和其后的二倍化进程中可能经历基因组休克效应。但对于相关演化遗传机制是什么、机制是否相同等问题,存在不同假说和许多尚待澄清的问题(PNAS 2016及其他文献)。在张亚平院士领导下,云南大学省部共建云南省生物资源保护与利用国家重点实验室罗静教授、中科院昆明动物研究所吕雪梅研究员、湖南师范大学

2020-06-24

Nat Commun:胆固醇药物可有效缓解乳腺癌细胞脑部扩散

圣母大学的一项新研究表明,用于治疗高胆固醇的药物可能会干扰乳腺癌细胞适应大脑微环境的方式,从而阻止癌症向脑部的扩散。

2020-06-18

R环结构或能与转录因子Sox2协调作用来调节细胞重编程的多能性

2020年6月14日 讯 /生物谷BIOON/ --R环(R-loops)细胞中的特殊结构,其由RNA-DNA杂交体和可被取代的单链DNA组成,通常在转录基因附近被发现,然而,R环通常也是一种动态和广泛的实体结构,其在基因组中扮演着并不明确的调节和表观遗传角色。图片来源:CC0 Public Domain近日,一项刊登在国际杂志Science Advance

2020-06-14

研究揭示拟南芥DOF转录因子CDF4加快叶片衰老和花器脱落的新机制

 6月2日,国际学术期刊EMBO Reports 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心蔡伟明研究组题为Transcription factor CDF4 promotes leaf senescence and floral organ abscission by regulating abscisic acid and reactive

2020-06-05

通过刺突蛋白上添加或移除糖分子或有望改变SARS-CoV-2的侵袭性

2020年5月26日 讯 /生物谷BIOON/ --目前,科学家们一直在追踪新型冠状病毒的遗传组成,以便能够更好地理解病毒传播扩散的机制,为此研究人员分析了患者高血糖与疾病严重性之间的关联,从而就为揭示不同类型病毒的感染机制提供新的思路,具体来说,病毒刺突蛋白上糖分子的存在的存在就能够帮助有效区分不同类型的病毒。图片来源:CDC/Dr. Fred Murph

2020-05-26