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Computational and Structural Biotechnology Journal:基于人工智能预测模型实现源蛋白的高水平表达

近日,生物所微生物蛋白设计与智造团队与国内外多家科研单位开展合作,成功构建人工智能预测模型MPEPE,基于深度学习和分子进化的策略模拟分析异源基因在大肠杆菌中表达,提高了异源蛋白在大肠杆菌中的表达量。该研究促进了对基因序列与蛋白可溶性表达之间关系的认识,并为酶蛋白的理性分子设计提供了新方法。相关研究成果发表在《计算与结构生物技术期刊(Computationa

2022-03-13

Nucleic Acids Research:同济大学王晨飞团队开发空间转录组分析算法——STRIDE

近些年,高通量单细胞测序技术的发展,使得研究人员能够在单细胞分辨率研究复杂生物系统中细胞的异质性,但在实验过程中需要经历组织消化等操作,导致细胞在组织中原始位置信息的丢失。新兴的空间转录组学技术则在定量基因表达水平的同时,保留了细胞的空间信息,研究人员得以在空间背景下研究细胞不同的功能状态以及细胞间的相互作用。然而,由于技术的限制,目前大多数空间转录组或是检

2022-03-12

eLife:科学家发现向日葵调控紫外线模式的关键转录因子

花朵是植物繁殖的重要组成部分,花朵独特的颜色、形状和图案吸引了特定的花粉传播媒介,同时可以有助于保护植物免受捕食者和恶劣环境带来的不良影响。许多花朵含有吸收紫外线光 (UV) 的色素以显示不同紫外线图案,虽然人眼看不见,但大多数传粉者都能看到它们。例如,当在紫外线下观察时,向日葵的特征是“靶心”形状,中心暗周围有反射性外环,这种图案可以增加昆虫传播向日葵花粉

2022-03-05

Nature子刊:发现Tcf1转录因子在T细胞免疫记忆和二次免疫应答中的重要调控作用

美国哈肯萨克大学医学中心 (Hackensack University Medical Center) 薛海晖教授团队和弗吉尼亚大学 (University of Virginia) 臧充之教授团队合作在《自然—免疫学》(Nature Immunology)上发表了题为“Tcf1 preprograms the mobilization of glycoly

2022-03-09

Nat Commun:科学家揭示人类转录因子的调节机制

来自芬兰赫尔辛基大学等机构的科学家们进行了一项关于人类转录因子的新型大规模研究,该研究结合了两种最先进的交互组学技术,或能快速识别出蛋白质-蛋白质之间的相互作用,同时研究人员还提出了重要的基因家族的广泛功能信息。

2022-02-20

癌细胞发射“糖衣炮弹” 小鼠生存期延长

嵌合抗原受体(CAR)T细胞免疫治疗在难治性B细胞恶性肿瘤患者中显示出非凡的成功。然而,首次对实体肿瘤进行的人体研究揭示了导致该疗效不佳的独特障碍。理解CAR-T细胞识别肿瘤的决定因素应该转化为能够克服耐药性的策略的设计。

2022-02-08

Science:研究揭示CpG岛结合蛋白BEND3调控分化过程中二价基因转录的功能

   中国科学院生物物理研究所朱冰课题组与许瑞明课题组合作,在《科学》(Science)上,在线发表了题为Highly enriched BEND3 prevents the premature activation of bivalent genes during differentiation的研究论文,报道了CpG岛结合蛋

2022-02-15

我国科学家揭示活化转录因子4调控造血干细胞衰老的机制

  造血干细胞衰老与机体的衰老密切相关,但其机制仍不清楚。近日,南方医科大学的研究团队在《Science Advances》发表了题为“Loss of ATF4 leads to functional aging-like attrition of adult hematopoietic stem cells”的文章,认为活化转录因子4(

2022-01-28

Front Cell Neurosci:逆转录转座子的表达在亨廷顿氏症中或会受到抑制

来自意大利的科学家们通过研究发现,逆转录转座子的表达或许在亨廷顿氏症中会受到一定的抑制。

2022-01-31

Am J Transplant:首次成功将两个转基因猪肾移植到一名脑死亡的人类受者体内,种移植或许不是梦

在一项新的研究中,来自美国阿拉巴马大学伯明翰分校的研究人员概述了将经过基因修饰的临床级猪肾成功移植到一名脑死亡的人类受者体内,取代这名受者自身的肾脏。这一积极的研究结果表明,异种移植有可能解决全球器官短缺的危机。

2022-01-31