科学家发表非编码RNA相互作用数据库NPInter v4.0
非编码RNA对生物分子的调控作用，一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中，非编码RNA被发现可以和蛋白质、RNA以及基因组相互作用，调控复杂生物过程。比如经典的长非编码RNA Xist可以和X染色体相互作用并影响剂量补偿效应。理解非编码RNA和生物分子的相互作用对于研究非编码RNA的功能以及生物分子调控网络的构建是非常重要的。10月31日，《核酸研究》（Nucleic Acids
JCIM：计算提升蛋白质-蛋白质相互作用的预测精度
蛋白质-蛋白质相互作用和识别在生物学过程中有着非常重要的作用。尽管结构生物学已经取得了较大的进展，但直接采用实验方法确定蛋白质-蛋白质复合物结构仍然非常困难。分子对接技术是预测蛋白质-蛋白质复合物结构的有效方法。蛋白质-小分子之间的相互作用一般蛋白质受体有结合口袋，相互作用区域比较明确，而蛋白质-蛋白质相互作用则有可能发生在两个蛋白质表面上任何区域。因此，蛋白质-蛋白质相互作用的预测，需要对蛋白质
活细胞中蛋白质相互作用研究取得进展
近日，中国科学院上海药物研究所陈小华课题组和中国科学院成都生物研究所唐卓课题组合作，基于开发新的非天然氨基酸，发展了一种能够在活细胞中捕捉蛋白质相互作用的新技术，该方法兼具时空可分辨和交联位点选择性的优势。研究成果“Genetically Encoded Residue-Selective Photo-Crosslinker to Capture Protein-Protein Interacti
Cell：系统性构建出病毒与人类宿主之间的蛋白-蛋白相互作用图谱
2019年9月7日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国哥伦比亚大学的研究人员利用一种计算方法绘制出所有已知感染人类的病毒与它们感染的宿主细胞之间的蛋白-蛋白相互作用图谱。这种方法及其产生的数据已给出了大量关于病毒如何操纵它们感染的宿主细胞和引起疾病的信息。这项研究的发现包括雌激素受体在调节寨卡病毒感染中的作用和人乳头瘤病毒（HPV）如何导致癌症。相关研究结果于2019年8月29日
Infect & Immun：科学家成功揭示肠道中宿主和肠道菌群的相互作用机制
2019年9月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Infection and Immunity上的研究报告中，来自范德堡大学的科学家们通过研究揭示了机体肠道中宿主-微生物之间的相互作用。尽管目前研究人员非常清楚人类和肠道微生物之间的有益相互作用，但他们并不是非常清楚宿主如何影响机体肠道菌群的功能。图片来源：L.rhamnosus GG研究者Fang Yan博士表示，此前我们
阿司匹林或能与细胞的DNA甲基化相互作用改变乳腺癌患者的预后！
2019年8月21日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Cancer上的研究报告中，来自北卡罗来纳大学的科学家们通过研究发现，如果在被诊断为乳腺癌前服用阿司匹林，基因组特定区域携带特殊DNA特征的女性或许存活时间会更长一些，本文研究提示，后期研究人员或许需要深入研究阿司匹林在预防或治疗乳腺癌患者上的潜力。图片来源：CC0 Public Domain目前研究人员并不清楚为何某些患
PLoS ONE：揭示肠道免疫细胞之间相互作用发生的分子机制
2019年8月12日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志PLoS ONE上题为“Innate CD8αα+ cells promote ILC1-like intraepithelial lymphocyte homeostasis and intestinal inflammation”的研究报告中，来自范德堡大学的科学家们通过研究揭示了肠道免疫细胞之间相互作用的分子机制。图
美国科学院院士庄小威团队开拓测量DNA与蛋白质相互作用新技术
许多基因组处理反应，包括转录、复制和修复，都会产生DNA旋转。直接测量DNA旋转的方法，如转子珠跟踪、角度光学捕获和磁性镊子，有助于揭示一系列基因组加工酶的作用机制，包括RNA聚合酶（RNAP），gyrase，病毒DNA包装机器和DNA重组酶。尽管旋转测量有可能改变我们对基因组处理反应的理解，但测量DNA旋转仍然是一项艰巨的任务。现有方法的时间分辨率不足以跟踪在生理条件下由
Cell Rep：研究揭示与阿尔茨海默氏症相关的蛋白-基因相互作用图谱
2019年8月3日讯 /生物谷BIOON /——在诊断和治疗阿尔茨海默病(AD)的过程中，有一个事实是，无症状和有症状的退化性疾病患者可能有相似的神经病理学负担，但认知能力下降的速度却有显着不同。2019年7月23日发表在《Cell Reports》上的一项新的研究中， 加州大学圣地亚哥（UCSD）医学院领导的一个研究小组使用转录组学（基因表达的所有信使核糖核酸(mRNA)分子的聚集体）比较了41
Nature：中美科学家揭示钙粘蛋白介导的细胞间相互作用调节癌细胞铁死亡机制
2019年7月30日讯/生物谷BIOON/---铁死亡（ferroptosis）是一种由细胞代谢和铁依赖性脂质过氧化作用驱动的细胞死亡过程。它与缺血性器官损伤和癌症等疾病有关。谷胱甘肽过氧化物酶4（GPX4）是铁死亡的一种至关重要的调节剂，通过中和脂质过氧化物来保护细胞，其中脂质过氧化物是细胞代谢的副产物。直接抑制GPX4，或通过剔除它的底物谷胱甘肽或用于产生谷胱甘肽的前体分子（比如半胱氨酸）间接