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研究人员预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标识别机制

中国科大刘海燕教授、陈泉教授课题组与复旦大学王文宁教授合作,采用蛋白质结构预测、序列设计等计算手段与蛋白质互补分析和深度突变扫描、X射线晶体学、NMR等实验结合的方法,揭示了固有无序的4.1G蛋白C端

2023-10-07

Science:揭示核糖核苷酸还原酶在自由基状态下的三维结构

尽管 DNA 在生物学中发挥着基础性作用,而且半个世纪以来对它进行了大量研究,但 DNA的构成单元(building block)是如何形成的许多方面仍不清楚。如今,在一项新的研究中,来自瑞典斯德哥尔

2023-10-16

Science:从结构上揭示MKK6-p38α复合物激活机制

细胞持续暴露于病原体等应激源,可能会扰乱生物的正常功能。为了对抗应激,细胞产生了多种应对机制,包括炎症反应。虽然炎症反应是必要的,但过多的炎症反应会损害细胞和器官的功能。细胞因子风暴就是这种情况---

2023-09-26

华人团队揭示年龄对纳米递送系统的影响

这些结果揭示了纳米药物在细胞吞噬摄取和清除方面的年龄相关性差异,这影响了纳米药物的抗肿瘤反应,从而为适合年龄的癌症纳米药物方法提供了强有力的理论基础。

2023-09-21

Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高

与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任

2023-10-17

Nature:利用新开发的 Foldseek Cluster算法一次性分析大量的蛋白结构

在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、瑞士生物信息学研究所和韩国首尔国立大学等研究机构的研究人员通过开发一种有效的方法来比较 AlphaFold 数据库中的所有预测蛋白结构,揭示了不同物种蛋白

2023-09-27

Nature子刊:复旦大学马剑鹏团队开发智能算法,大幅提升冷冻电镜蛋白结构解析分辨率

作为蛋白质结构预测领域顶尖团队,由诺贝尔奖得主 Micheal Levitt 教授和马剑鹏教授领导的复旦大学复杂体系多尺度研究院,聚焦基础科学、交叉学科及源头底层技术,致力于推动生物大分子结构实验测定

2023-10-13

神秘「血浆疗法」来源公布,可将生理年龄降低50%,即将针对狗进行试验

除了 E5 之外,Yuvan Research 还开发了一种铜肽外用凝胶,称为 Neel(也称为“蓝色凝胶”)。

2023-09-04

上海交大邓子新团队受邀撰写NPR封面文章——迭代式Ⅰ型聚酮合酶的结构酶学

尽管在近20年里,人们对于type I iPKSs的研究取得了长足的进展,但其复杂多变的编程式催化现象依然难以预测。然而,基于人工智能的Alphafold2

2023-10-03

研究揭示异常剪切体蛋白结构

交我算团队专注于提供学科融合服务,帮助全校课题组有效利用高性能计算、AI计算和云计算等强大计算资源。团队由30多人组成,来自物理、化学、生物、材料等多个学科,致力于全校科研计算交叉与创新。

2023-08-14