Science：利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础
Puffin程序显示，根据这些序列模式的排列方式，它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。
2024-05-26
Nat Methods | 田鲁亦/刘晓东团队系统性评估11种空间组学技术
通过评估，不同技术方案各有优劣，并且一些国产的技术平台的指标已经达到领先，凸显了中国在这一新兴领域的快速发展趋势。
2024-07-16
4年前的重磅Nature论文被撤稿：微生物组与癌症的相关性竟源自错误分析
近日，Nature 期刊撤回了题为：Microbiome analyses of blood and tissues suggest cancer diagnostic approach 的研究论文。
2024-07-19
空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型，用于刻画肿瘤微环境。
2024-07-02
Nature： 新开发的TATSI技术利用转座元件将定制DNA整合到植物基因组的特定位点
TATSI 技术利用了植物转座元件 20 多亿年进化的优势，这些转座元件就像经过磨练的分子机器，自然而然地将 DNA 导入宿主基因组中。
2024-07-14
Nature：新研究发现桥接重组酶机制，有望开发下一代可编程基因组设计系统
研究发现了一种DNA重组酶，这种酶利用非编码RNA对目标DNA分子和供体DNA分子进行序列特异性选择，允许用户确定任何所需的基因组目标序列和任何要插入的供体 DNA 分子。
2024-07-17
BBI：化疗或会扰乱乳腺癌患者机体的肠道微生物组功能
研究结果表明：1）化疗会诱导机体微生物组的破坏和炎症；2）由此所产生的微生物组干扰与认知功能下降和炎症发生有关；3）那些认知功能受损的患者拥有独特的化疗诱导微生物组的改变。
2024-07-06
Nature Methods | 何爱彬/舒绍坤团队合作开发单细胞药物基因组靶点检测新技术解析表观耐药机制
scEpiChem提供了一个全面的高通量分析框架，捕捉了传统bulk分析无法实现的小分子药物反应的细胞异质性特征。
2024-07-20
Science：科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序，当分析了数以万计已知的人类启动子数据后，这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成，即基序、启动子和三核苷酸（trinucleotides）。
2024-05-27