Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
Nature:首个人类大脑血管分子图谱震撼发布!为跨学科合作搭建了桥梁
这份详尽的单细胞大脑血管图谱,不仅为我们提供了关于发育、成年及疾病状态下人类大脑血管系统分子架构与异质性的深度洞察,更为后续研究奠定了坚实的基础,预示着脑科学领域即将迎来一场革命。
Cell:首次构建出食物中的化合物与人体肠道细菌相互作用的分子图谱
这种分子图谱为解释不同人群之间的这些不同反应提供了一种机制,显示了膳食化合物如何影响肠道微生物的生长,以及该化合物在代谢上如何被肠道微生物群落改变。
Science:我国科学家揭示人类癌症中肿瘤浸润B细胞的图谱
这项研究加深了人们对肿瘤浸润B细胞异质性作用的认识。它可能会为那些对当前免疫疗法产生抵抗性的癌症患者提供新的治疗机会。
Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
Cell:新的图谱针对基因如何在早期胚胎发育中起作用提供新见解
研究人员开发了一种自动系统,用于分析胚胎发生所需的基因功能,其中胚胎发生是受精卵从单细胞发育成具有皮肤、消化道、神经元和肌肉等不同组织的有机体的过程。
冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱获得进展
中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军研究组利用RNA-seq、ATAC-seq和CUT&Tag技术,绘制了田间冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱。
Dev Cell:余逸群/余洪猛/刘环海/任雯雯绘制嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱
该研究建立了哺乳动物嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱(图1),解析嗅上皮细胞类型特异性的衰老相关差异表达基因,发现衰老导致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是转录调控网络中的核心因子。
科研人员描绘小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱
该研究利用高精度大视场时空组学Stereo-seq和单细胞转录组测序技术DNBelab C4,系统描绘了小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱。