Journal of Genetics and Genomics:单细胞分辨率绘制水稻幼苗叶和根的转录组图谱
水稻作为重要的粮食作物,为全球一半以上的人口提供主粮;同时,水稻作为单子叶模式植物,其个体发育与细胞分化受到了科研人员持续和广泛的关注。细胞功能的分化常常可以体现为基因表达的差异。新兴的单细胞转录组测序技术使高通量探究细胞的功能分化成为可能。绘制水稻全苗单细胞转录图谱将为单子叶植物的研究工作提供关键的基础资源,为理解植物发育的转录调控
PNAS:玉米B染色体基因组图谱和功能研究获进展
一个多世纪前发现,B染色体在较多植物、动物和真菌基因组中存在。B染色体对于个体的生命活动来说不是必需的,但它们仍通过不同的机制存在于种群中。例如,玉米B染色体不与任何A染色体配对,其传递不遵循孟德尔遗传定律,花粉第二次有丝分裂B染色体会发生不分离(nondisjunction),包含B染色体的精核优先与卵细胞受精,使其能够在群体中传递
Genome research:孙良丹教授团队绘制首个中国人群蛋白截断突变图谱并揭示其对银屑病发病机制的重要影响
6月21日,安徽医科大学第一附属医院皮肤科,安徽医科大学皮肤病研究所和皮肤病学教育部重点实验室孙良丹教授团队在国际著名学术期刊Genome research(IF:11.1)发表了题为“Deep sequencing of 1,320 genes reveals the landscape of protein-truncating
研究绘制人类心脏多组学图谱
心脏是哺乳动物胚胎发育过程中形成的第一个功能器官,由四个腔室组成。生命从早期胚胎形成到成体的每一刻都需要心脏不间断地发挥作用。近年来,与心脏相关的疾病已经成为危害人类健康的重要原因。心脏发育及心脏疾病相关的研究迫在眉睫,而各种高通量测序技术的出现为心脏有关的研究带来了新的曙光。以往的研究大多报道单组学的心脏图谱,对哺乳动物心脏多组学之间的互作及调控仍然知之甚
冰河时代东亚人群遗传图谱和适应性基因演化研究取得进展
谈到几万年前的冰河时期,我们会联想到动画电影系列“冰河时代”中古代人类形象和当时与其共存的猛犸象、剑齿虎等已灭绝动物的卡通形象。我们也会不禁追问,当时的东亚人是如何生活的,他们和我们有什么区别吗?研究表明,冰河时期(尤其是末次盛冰期)的气候变化对欧洲人群的迁徙和种群大小变化具有影响,考古证据表明其对亚洲高纬度和高海拔地区的人群历史也有
Protein & Cell:绘制出灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱
海马体作为脑的重要组成部分,在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长,海马功能逐渐退化,导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂,细胞组成具有高度异质性,传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外,由于伦理及样本来源的限制,不同年龄阶段的健康人类海马组织很难获取,这在一定
科研人员解锁冰河时代东亚人群遗传图谱和适应性基因演化
谈到几万年前的冰河时期,我们会联想到动画电影系列“冰河时代”中古代人类形象和当时与其共存的猛犸象、剑齿虎等已灭绝动物的卡通形象。我们也会不禁追问,当时的东亚人是如何生活的,他们和我们有什么区别吗?研究表明,冰河时期(尤其是末次盛冰期)的气候变化对欧洲人群的迁徙和种群大小变化具有影响,考古证据表明其对亚洲高纬度和高海拔地区的人群历史也有
研究发布恒河猴参考基因结构 揭示人类转录本演化新机制
作为人类近缘的非人灵长类模式动物,恒河猴在脑科学、分子演化、药物研发等基础与转化研究中发挥着不可替代的作用。然而,目前恒河猴基因结构主要源于预测,严重制约了该特色模型在分子水平的研究与应用。近日,北京大学分子医学研究所李川昀教授课题组运用全长转录本测序技术,开发了生物信息学新方法,重新准确定义了恒河猴全长基因结构,并以此为基础探究了多聚腺苷酸化(polyad
Science:揭示人类纹状体发育的单细胞图谱
2021年5月9日讯/生物谷BIOON/---纹状体(striatum)调节着人类社会行为的不同特征,也是在许多神经系统疾病中受到影响的区域。在一项新的研究中,来自意大利、英国和美国的研究人员构建出人类早期胎儿发育过程中该区域的综合单细胞图谱,同时考虑了蛋白编码转录物和长基因间非编码RNA(long intergenic noncoding RNA, lin
EMBO J:新型细胞图谱或能帮助绘制出人类健康和癌变的乳腺组织
2021年5月16日 讯 /生物谷BIOON/ --乳腺癌包括一系列不同的疾病,其主要特点是异质性,这会影响患者对疗法的反应以及其预后,这种异质性并不能通过组织病理学、肿瘤等级和结节的参与等经典的参数来进行精确定义;为了研究不同状态下乳腺异质性的整体改变,日前,一篇刊登在国际杂志The EMBO Journal上题为“A single‐cell RNA ex