研究揭示小鼠早期胚胎发育过程中全胚层谱系发生的时空转录组图谱
8月8日，国际学术期刊《自然》（Nature）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组、中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组与中国科学院广州生物医药与健康研究院/广州再生医学与健康广东省实验室彭广敦课题组共同合作的最新研究成果：Molecular architecture of lineage allocation and tissue
Nature：利用单细胞转录组学揭示成神经管细胞瘤不同亚型的细胞组成
2019年7月28日讯/生物谷BIOON/---成神经管细胞瘤（medulloblastoma）是一种恶性儿童小脑肿瘤类型，包含不同的分子亚型。成神经管细胞瘤已被分为四种不同的分子亚型：WNT和SHH（均由它们的同名基因发生的突变驱动），组3和组4。组3和组4占所有成神经管细胞瘤病例的60％，但是也最少被人理解的。这部分上是因为当前没有在遗传上准确地模拟组4的实验室模型。此外，尽管这些亚型的基因组
Cell Stem Cell：构建单细胞图谱，将心脏瘢痕组织细胞重编程为健康的心肌细胞
2019年6月25日讯/生物谷BIOON/---每年有79万名美国人遭受心脏病发作，这会让受损的瘢痕组织存在于心脏中，并限制心脏的高效跳动能力。但是，如果科学家们能够将称为成纤维细胞的瘢痕组织细胞重编程为健康的心肌细胞会怎样呢？人们通过实验室实验和小鼠研究在这方面取得了很大进展，但人类心脏重编程仍然是一项巨大的挑战。如今，在一项新的研究中，来自美国北卡罗来纳大学教堂山分校和加州大学欧文分校的研究人
科学家绘制造血干细胞扩增组织的3D转录组图谱
血液系统中贮藏着一种具有自我更新、分化成各种血细胞潜能的成体干细胞，称为造血干细胞，它能够维持机体长久造血和组织稳态。造血干细胞移植是恶性血癌的有效治疗手段，但干细胞来源不足成为限制该治疗广泛应用的瓶颈。因此，造血干细胞的发育，尤其是造血干细胞扩增的研究备受关注。然而，现在的研究主要集中在特定细胞群体或关键因子的“线性化”或“平面化”解析，缺乏全面“立体化”的分析。从系统生物学角度解析
Nature：首次对阿尔茨海默病进行单细胞转录组分析
2019年5月13日讯/生物谷BIOON/---在美国，阿尔茨海默病影响了500多万人。在一项新的研究中，来自美国麻省理工学院的研究人员首次对阿尔茨海默病患者的单个脑细胞中表达的基因进行了综合分析。所获得的分析结果允许他们鉴定出在神经元和其他类型的脑细胞中受到影响的独特细胞通路。这一分析可能为阿尔茨海默病提供许多潜在的新型药物靶点。相关研究结果于2019年5月1日在线发表在Nature期刊上，论文
清华李梢组在Cell子刊首次解析胃炎癌转化单细胞网络，发现胃癌极早期标志物
Nat Methods：开发出一种新的基因组学工具ECCITE-seq，可扩展多模式单细胞分析
2019年5月10日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国纽约基因组中心的研究人员开发出一种称为ECCITE-seq的新技术，它允许科学家们对来自单细胞的多种信息模式进行高通量测量。相关研究结果发表在2019年5月的Nature Methods期刊上，论文标题为“Multiplexed detection of proteins, transcriptomes, clonotype
Cell：利用uliCUT&RUN方法在单细胞和单个胚胎中构建染色质上的蛋白结合图谱
2019年4月24日讯/生物谷BIOON/---在一项新的突破性研究中，来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN（cleavage under targets and release using nuclease）的方法进行改进，使得在使用少量细胞（包括单细胞和单个植入前胚胎）的情形下，它适合用来研究转录因子和其他的DNA结合蛋白在染色质上的占据情况。相关研
Nat Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
2019年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结合特殊位点时，人类机体中超过1500种转录因子的的效
Nature：利用单细胞谱系图谱追踪细胞直接重编程
2018年12月13日/生物谷BIOON/---直接细胞谱系重编程涉及细胞身份转换，比如Fábio F. Rosa等人近期发现让小鼠成纤维细胞表达三种转录因子PU.1、IRF8和BATF3就可直接将它们重编程为呈递抗原的树突细胞，此外，让人类成纤维细胞表达这三种转录因子也可实现这一点（Science Immunology, 07 Dec 2018, doi:10.1126/sciimmunol.a