Nature：利用单细胞谱系图谱追踪细胞直接重编程
2018年12月13日/生物谷BIOON/---直接细胞谱系重编程涉及细胞身份转换，比如Fábio F. Rosa等人近期发现让小鼠成纤维细胞表达三种转录因子PU.1、IRF8和BATF3就可直接将它们重编程为呈递抗原的树突细胞，此外，让人类成纤维细胞表达这三种转录因子也可实现这一点（Science Immunology, 07 Dec 2018, doi:10.1126/sciimmunol.a
利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性
2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的，但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成，而转录组指的是在某一特定条件下，细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中，细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化，因此染色质可接近性有
首次构建出哺乳动物单细胞染色质可接近性图谱
2018年8月26日/生物谷BIOON/---科学家们对DNA缠绕和包装到所谓的染色质中的方式感兴趣，这是因为这会影响每个细胞中可用到的遗传信息。DNA就像串在一根绳子上的念珠。在这些分子“念珠”移动的地方会有空间形成，这样蛋白就能够访问和“读取”遗传信息。这种状态或者说这种基因组特征就是染色质可接近性（chromatin accessibility, 也译作染色质开放性）。在一项新的研究中，来自
独家专访中国学者《Nature》子刊发布最大规模肺癌T细胞单细胞免疫图谱
小编推荐：您不可错过的2018单细胞组学技术与应用研讨会2018年6月26日凌晨1:00，《Nature Medicine》发表迄今针对肿瘤相关T细胞的规模最大的单细胞组学研究，北大张泽民教授团队通过非小细胞肺癌12,346个T细胞的单细胞测序及分析，发现了可能的肺癌新靶点。图1： 肿瘤免疫细胞单细胞测序流程图，图片来自《Natur
Science：构建出真涡虫细胞类型转录组图谱
2018年4月24日/生物谷BIOON/---真涡虫是一类相对简单的动物，具有不同寻常的生物学特征：成年真涡虫维持着其他有机体仅在胚胎中短暂存在的发育信息和祖细胞（progenitor cell）。真涡虫获得人们的大量研究，部分原因在于它们具有再生丢失的或受损的身体部位的独特能力。图片来自Christopher Fincher/Whitehead Institute。在一项新的研究中，来自美国怀特
Cell:基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表
在国家自然科学基金项目（项目编号：31722027）等资助下，浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板测序技术绘制小鼠细胞图谱）为题，于2018年2月23日在生命科学国际顶尖期刊Cell（《细胞》）
Nature：研究绘制出人脑前额叶发育的单细胞图谱
近日，中国科学院生物物理研究所王晓群课题组、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心汤富酬课题组、北京大学第三医院乔杰课题组和首都医科大学附属安贞医院张军课题组合作，绘制出人脑前额叶胚胎发育过程的单细胞转录组图谱，并对其中关键的细胞类型进行了系统功能研究，为绘制完整的人脑细胞图谱奠定重要基础。相关研究成果以Single-cell RNA-Seq surveys a developmental lands
单个细胞转录组测序成本降至1美分！《科学》期刊发布重磅SPLit-seq技术
许多疾病，例如阿尔兹海默病和帕金森病，都源于某些类型细胞的功能障碍。对这些类型的细胞进行深度分析、发掘致病基因，将有助于了解疾病的病因和进展情况，进而帮助开发出相应的治疗方法。通过单细胞RNA测序技术对细胞进行分类是现阶段重要的研究方向，但是现有方法价格昂贵，且需要专门的设备，严重阻碍了单细胞研究的广泛开展。近日，一项最新研究成果为单细胞测序技术带来了突破，有望将单个细胞的测序成本降至
科学家揭示整合单细胞和群体细胞转录组数据推断细胞分化时间的作用
近日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）马普计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组，中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组，与清华大学沈沁研究组合作发表的论文，以Inference of differentiation time for single cell transcriptomes using cell population reference data为题，在线发表
利用单细胞转录组分析揭示成纤维细胞转化为心肌细胞机制
图片来自Qian Lab, UNC School of Medicine。2017年10月28日/生物谷BIOON/---在心脏病发作后，通过逆转瘢痕组织产生健康的心肌组织将会引发心脏学和再生医学领域的变革。在实验室中，科学家们已证实将心脏成纤维细胞（瘢痕组织细胞）转化为心肌细胞是可行的，但是梳理出这是如何发生的细节并不是件容易的事情，而且将这种方法用于临床实践或甚至其他的基础研究项目中一直都是难