专访空间转录组学技术的探路者---青年科学家彭广敦
编者按:空间转录组学技术是转录组学研究领域的新方向,也是研究细胞异质性方面的新方法。该技术通过整合与优化单细胞测序和激光显微切割技术, 获得少量细胞转录组信息的同时可以保留细胞原有位置信息。为此, 生物谷专访了该技术的主要开发者-中国科学院上海生化细胞所彭广敦副研究员
掀开空间转录组学技术的面纱:可视化观察组织中的基因表达
在一项新的研究中,来自瑞典卡罗琳斯卡研究所和皇家理工学院等机构的研究人员开发出一种新的被称作空间转录组学(spatial transcriptomics)的高分辨率方法研究一种组织中哪些基因是有活性的。这种方法能够被用于所
文路研究员:肝癌异质性的单细胞三重组学及ccfDNA甲基化组分析
2016年4月25日讯/生物谷BIOON/--4月23日,肿瘤异质性学术研讨会在上海好望角大饭店进入第二天的议程,北京大学生物动态光学成像中心高级助理研究员文路发表题为《肝癌异质性的单细胞三重组学分析及肝癌患者循环游离D
单细胞全基因组测序——求同存异,追本溯源
细胞是生命体结构和功能的基本单位,人类对生命本源的不断探索推动了科学技术的发展。单细胞全基因组测序是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术,它对单个细胞异质性的研究不仅在表观遗传学、植物学、
单细胞测序再创新突破,安诺基因建立国内首家基因组与转录组平行测序技术平台
2015年4月27日,Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术,基因组与转录组平行测序。该技术实现了对单个细胞内的DNA和RNA平行测序,能够展现单个细胞的基因变异与基因功能之间的关系。
北大教授开发单细胞全转录组测序新技术
2014年4月29日,北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的论文。
:新基因组测序方法能够在单细胞水平上分析基因表达谱
生物学家和遗传学家长期以来想要在单个细胞水平上分析基因表达谱,但是技术限制一直使得它不能成为现实。 根据2012年7月22日在线发表在Nature Biotechnology期刊上的一项研究,研究人员第一次证实一种新的被称作Smart-Seq的基因组测序方法能够帮助科学家们对临床上重要性的单个细胞进行深入分析。Smart-Seq可能有着很多方面的应用,包括帮助科学家们更好地理解肿瘤产生的复杂性。
Nat Biotechnol && J Comput Biol:开发出新算法对单细胞基因组进行测序
2012年8月13日 讯 /生物谷BIOON/ --美国加州大学圣地亚哥分校计算机科学家Pavel Pevzner领导的一个国际研究小组开发出一种新的算法来对有机体单个细胞的基因组进行更加快速地和更加准确地测序。这个新的算法被称作SPAdes,能够被用来对不能利用标准克隆技术进行处理的细菌进行测序,其中研究人员将这些细菌称作生命的暗物质,比如医院中发现的一些病原体,在深海或人胃肠道中存在的细菌。
贺建奎:单细胞基因组学的兴起
上周在美国冷泉港(Cold Spring Harbor)参加了单细胞分析会议(single cell analysis), 这是一个非常令人激动的前沿学术会议,深深的体会到了单细胞基因组学的时代已经来临。 Cold Spring Harbor的会议是公认的高水准的会议,它有几个特点:首先,所做的报告都是最新的研究,组织方特别强调,希望介绍尚未发表的研究进展。