Genome Res:科学家开发出能对单细胞进行大规模分析的新型工具—BigSCale
2018年6月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Genome Research上的研究报告中,来自西班牙的研究人员通过研究提出了一种复杂的计算机框架来分析单细胞的基因表达水平,这一技术可以扩展到对数百万个独立的细胞进行分析处理,这项研究中,研究人员首次开发了一种工具来分析诸如大规模的单细胞RNA序列数据库,这或能极大地扩展单细胞基因组学的研究范围。图片来源:xoomtr
《Cell》:单细胞组蛋白修饰模型展示表观遗传多样性随着衰老而增加
染色质修饰包括组蛋白转录后修饰,组蛋白多样性。连同DNA一起调控表观遗传表型。虽然染色质修饰在多种生理学过程和人类疾病中都有重要的意义,但是由于此前存在的技术检测通道有限,无法同时检测各种免疫细胞亚群特异性marker和各种染色质修饰。因此在人类免疫细胞中进行染色质研究具有挑战性。近期出现的一个技术突破——质谱流式技术,可以在少量细胞甚至是单细胞中进行四十种以上参数采集,可以完美应对这一挑战。斯坦
Science:大量肾脏单细胞的RNA测序分析阐明慢性肾脏疾病的发病根源
2018年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --肾脏是一个非常复杂的器官,其功能远远不止一个简单的“过滤器”,肾脏要正常发挥功能,需要多个高度特异性的不同细胞类型之间相互作用来帮助机体通过尿液排出废物、平衡体液,调节血压并且分泌多种激素。图片来源:Katalin Susztak, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania近日一
Nat Biotechnol:新型算法或能在单细胞分辨率下对多种数据进行有效整合
2018年4月4日 讯 /生物谷BIOON/ --最近,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自纽约大学的研究人员通过研究开发出了一种新型算法,其能在单细胞分辨率下多多种测序数据集进行排列,这种新方法未来或有望用来帮助理解不同群体的细胞如何在疾病进展过程中发生改变以及如何对药物疗法产生反应。图片来源:www.phys.org研究者Rahul Satija说道,
人类细胞图谱取得首个进展,对25万个人发育细胞进行测序
小编推荐会议:2018(第九届)细胞治疗国际研讨会2018年3月26日/生物谷BIOON/---来自人类细胞图谱联盟(Human Cell Atlas Consortium)的研究人员在利用强大的单细胞基因组分析工具了解人类早期发育和这如何能够影响健康或导致疾病方面迈出第一步。迄今为止,人类发育细胞图谱(Human Developmental Cell Atlas, HDCA)的初步项目已对100
单细胞测序平民化,测一个细胞仅需一美分,一次能测上千个细胞!
2018年3月19日讯 /生物谷BIOON /——来自艾伦学院和华盛顿大学的科学家们开发出了一种廉价的高级技术可以检测成百上千个细胞的基因表达。这项基于配位的转录组测序技术(Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing,SPLiT-seq)是一项可延展的用于表征单个细胞RNA水平的技术,可用于鉴定脑部疾病及其他组织中的不同细胞类型,这项研究于
Cell:基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表
在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序技术绘制小鼠细胞图谱)为题,于2018年2月23日在生命科学国际顶尖期刊Cell(《细胞》)
Nature:研究绘制出人脑前额叶发育的单细胞图谱
近日,中国科学院生物物理研究所王晓群课题组、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心汤富酬课题组、北京大学第三医院乔杰课题组和首都医科大学附属安贞医院张军课题组合作,绘制出人脑前额叶胚胎发育过程的单细胞转录组图谱,并对其中关键的细胞类型进行了系统功能研究,为绘制完整的人脑细胞图谱奠定重要基础。相关研究成果以Single-cell RNA-Seq surveys a developmental lands
单个细胞转录组测序成本降至1美分!《科学》期刊发布重磅SPLit-seq技术
许多疾病,例如阿尔兹海默病和帕金森病,都源于某些类型细胞的功能障碍。对这些类型的细胞进行深度分析、发掘致病基因,将有助于了解疾病的病因和进展情况,进而帮助开发出相应的治疗方法。通过单细胞RNA测序技术对细胞进行分类是现阶段重要的研究方向,但是现有方法价格昂贵,且需要专门的设备,严重阻碍了单细胞研究的广泛开展。近日,一项最新研究成果为单细胞测序技术带来了突破,有望将单个细胞的测序成本降至
Science:开发出单细胞生物发光成像系统
2018年2月25日/生物谷BIOON/---萤火虫和水母等发光生物让科学家们很感有趣,这是因为它们的生物发光分子有助于可视化观察大量的生物过程。来源于萤火虫的萤光素酶催化底物D-荧光素,从而发出绿黄色的光。为了让这种发光过程更加高效,已有相当多的研究利用合成类似物(synthetic analog)替换荧光素和改进它们的催化速率。如今,在一项新的研究中,来自日本理化研究所的Atsushi Miy