:新基因组测序方法能够在单细胞水平上分析基因表达谱
生物学家和遗传学家长期以来想要在单个细胞水平上分析基因表达谱,但是技术限制一直使得它不能成为现实。 根据2012年7月22日在线发表在Nature Biotechnology期刊上的一项研究,研究人员第一次证实一种新的被称作Smart-Seq的基因组测序方法能够帮助科学家们对临床上重要性的单个细胞进行深入分析。Smart-Seq可能有着很多方面的应用,包括帮助科学家们更好地理解肿瘤产生的复杂性。
Nat Commun:遗传学: 蜘蛛基因组让我们认识毒液和蜘蛛丝是怎样生成的
本期Nature Communications报告了社会性丝绒蜘蛛的全基因组序列和狼蛛(毛蛛)的基因组序列草图。这项工作让我们对毒液和蜘蛛丝的生成中所涉及的基因和蛋白有所认识,并且还表明:这种信息有可能被用来分别推进有关毒液和蜘蛛丝的药理应用和生物材料应用。
Nat Biotechnol && J Comput Biol:开发出新算法对单细胞基因组进行测序
2012年8月13日 讯 /生物谷BIOON/ --美国加州大学圣地亚哥分校计算机科学家Pavel Pevzner领导的一个国际研究小组开发出一种新的算法来对有机体单个细胞的基因组进行更加快速地和更加准确地测序。这个新的算法被称作SPAdes,能够被用来对不能利用标准克隆技术进行处理的细菌进行测序,其中研究人员将这些细菌称作生命的暗物质,比如医院中发现的一些病原体,在深海或人胃肠道中存在的细菌。
贺建奎:单细胞基因组学的兴起
上周在美国冷泉港(Cold Spring Harbor)参加了单细胞分析会议(single cell analysis), 这是一个非常令人激动的前沿学术会议,深深的体会到了单细胞基因组学的时代已经来临。 Cold Spring Harbor的会议是公认的高水准的会议,它有几个特点:首先,所做的报告都是最新的研究,组织方特别强调,希望介绍尚未发表的研究进展。
Cell:搜寻小鼠基因组中T细胞的基因与标志
干细胞在分子水平发生了什么,使它成为一种细胞而不是另一种?在什么点上它被委以细胞命运,它又是如何被委任的?这些问题的答案一直未弄清楚。但现在,在一些标志着对干细胞命运了解向前迈进一大步的研究中,加利福尼亚理工学院的研究人员已追踪到确保某些干细胞成为T细胞的一种分级发育过程,其中T细胞是帮助破坏入侵病原体的免疫细胞。
Science:单细胞基因组测序
2012年12月22日讯 /生物谷BIOON/-- 基因组测序需要用PCR技术扩增出足够量的DNA片段。由于PCR扩增具有偏好型而且基因组具有大量的冗余,造成了基因组测序准确性不高。
PLoS Pathog:基因组学角度深入解析病原菌致病的分子机制
2012年9月17日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在著名杂志PLoS Pathogens上的研究报告“Insights from Genomics into Bacterial Pathogen Populations”中,来自牛津大学人类遗传学中心的研究者从基因组学角度来深入剖析了致病菌的致病机制。 每年由于致病菌的感染、致病甚至死亡给全人类带来了巨大的精神和经济负担。
BJC:全基因组扫描技术为神经细胞瘤患者筛选出最优疗法
2012年9月15日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,伦敦癌症研究中心研究者领导的一项最新研究旨在通过全基因组扫描的方法,来鉴别出染色体上的大规模损伤,这或许可以帮助医生选择最优的疗法来治疗儿童神经细胞瘤疾病。相关研究成果刊登在了国际杂志British Journal of Cancer上。 神经细胞瘤(Neuroblastoma)是一种发育神经系统的癌症,可以引发儿童过早死亡。
PLoS ONE:傅金钟等系统发育基因组学研究获进展
系统发育基因组学研究,主要是利用基因组/转录组数据和基因组学方法解决重要类群的进化关系,从而揭示物种起源与分化以及多样性形成机制等重要问题。与传统的系统发育研究相比,系统发育基因组学具有信息量大、结果