科学家利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱
近日，澳大利亚昆士兰大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Atlas of group Astreptococcalvaccine candidates compiled using large-scale comparative genomics”的文章，利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱。A群链球菌（Group Astreptococcus，GA
宏基因组&代谢组学：两大组学共同揭示结肠直肠癌中肠道菌群的阶段特异性表型
近期，日本大阪大学 Shinichi Yachida 及其研究团队在医学著名期刊 Nature Medicine (IF=30.641)上发表题为“Metagenomic and metabolomic analyses reveal distinct stage-specific phenotypes of the gut microbiota in colorectal cance
Cell：人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示出新的治疗策略
近日，美国贝勒医学院及太平洋西北国家实验室的科学家们利用基因组蛋白组学相结合的分析技术首次对人类结肠癌的蛋白基因组进行了详尽的分析，全面剖析了结直肠癌相关生物标志物、药物靶点和肿瘤抗原，并在Cell杂志上发表题为“Proteogenomic Analysis of Human Colon Cancer Reveals New Therapeutic Opportunities”的文章。
Nat Commun：研究人员发现基因组的三维结构是如何调控细胞分化的
2019年5月31日讯 /生物谷BIOON /——明尼苏达大学医学院的一项新研究阐明了在骨骼肌形成之初，基因组的三维结构是如何被调控的。虽然基因组的DNA序列是一个线性的代码，就像一个很长的句子，但实际的DNA分子在三维空间中扭曲和折叠，其中一些序列彼此距离较远，但却在空间中物理上彼此接近。这些三维相互作用被认为可以使结合DNA的蛋白质调节离它们结合位置很远的基因的活动。图片来源：Nature C
Nat Methods：开发出一种新的基因组学工具ECCITE-seq，可扩展多模式单细胞分析
2019年5月10日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国纽约基因组中心的研究人员开发出一种称为ECCITE-seq的新技术，它允许科学家们对来自单细胞的多种信息模式进行高通量测量。相关研究结果发表在2019年5月的Nature Methods期刊上，论文标题为“Multiplexed detection of proteins, transcriptomes, clonotype
Cell：人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示出新的治疗策略
2019年5月8日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国国家癌症研究所、贝勒医学院、太平洋西北国家实验室、华盛顿大学、范德堡大学和得克萨斯大学卫生科学中心等研究机构的研究人员通过对来自患者的结肠癌组织产生的全部基因和蛋白的分析，对这种肿瘤有了更全面的认识，并指出新的癌症生物学机制和可能的新治疗策略。这项研究强烈支持对肿瘤组织的全面特征描述，并以此作为指导进一步研究的手段，以便开发早
精神分裂症功能基因组学研究中取得进展
精神分裂症是一种以阳性症状、阴性症状和认知障碍为主要特征的严重精神疾病，目前影响了全球约1%的人口。由于病因复杂，反复发作以及大多在青壮年发病，精神分裂症严重影响患者生活，同时也给患者家属和社会带来了沉重的经济和精神负担。精神分裂症的遗传力高达80%左右，表明遗传因素在精神分裂症的发生中有重要作用。近年来，全基因组范围内的关联研究（GWAS）已鉴别到超过180个与精神分裂症显着相关的遗
Cell：科学家鉴别出维持细胞基因组完整性的新型DNA修复机制
2019年3月2日 讯 /生物谷BIOON/ --日前，一项刊登在国际杂志Cell上的研究报告中，来自范德堡大学的科学家们通过研究鉴别出了保持基因组完整性的新型DNA修复机制。研究者表示，这种机制是由一种名为HMCES的蛋白质所开启的，HMCES是此前研究者所鉴别出的200多种蛋白质家族的一种，这些蛋白质属于特殊分子机器的一员，其能在细胞分裂时帮助DNA进行复制。其中有些蛋白质是用于与DNA复制相
Nat Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
2019年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结合特殊位点时，人类机体中超过1500种转录因子的的效
2018年基因组学研究盘点
2018年12月21日/生物谷BIOON/---2018年即将过去，本期为大家带来的是2018年度基因组学领域研究的相关盘点，希望读者朋友们能够喜欢。1. Nature：改写教科书！中国科学家阐明保护卵母细胞独特表观基因组的新型机制！DOI: 10.1038/s41586-018-0751-5在哺乳动物中，雌性机体的卵母细胞数量往往有限，卵母细胞拥有一套独特的表观基因组，其甲基化程度相当于精子的一