Forests:金豆的叶绿体全基因组解析研究中获进展
金豆【Fortunella venosa(Champ. ex Benth.) C.C.Huang】是芸香科中一种多年生常绿灌木。此物种为我国特有,分布区域与金柑【《中国植物志》 Fortunella hindsii (Champ. ex Hook.) Swingle】略有重叠,且范围狭窄,主要分布在福建南平和江西永丰等地,在湖南宁远、茶陵和桂东等地也有发现。
Briefings in Bioinformatics:发表多表型全基因组关联分析方法研究成果
近日,上海交通大学生命科学技术学院生物信息学与生物统计学系、上海交大-耶鲁生物统计与数据科学联合中心团队在《Briefings in Bioinformatics》(IF: 11.622)上发表题为“GESLM algorithm for detecting causal SNPs in GWAS with multiple phen
Journal of Genetics and Genomics:利用基因组编辑技术提高小麦氮素利用效率和产量
小麦为全球人口提供主粮,小麦增产可缓解人口增长带来的粮食危机。氮元素作为植物生长发育所必需的一类营养元素,是制约农作物产量的重要因素。对作物氮素利用关键调控基因进行靶向编辑,是改良作物产量的有效策略。前期研究发现,水稻ARE1基因是调控氮素利用效率和产量的关键基因。ARE1基因在植物中高度保守,研究人员推测,对其他作物中ARE1基因的
小麦基因组编辑递送系统研究获进展
植物基因编辑的一个关键步骤是将Cas9蛋白和sgRNA递送到植物细胞中发挥作用,目前植物中的递送方式主要有农杆菌和基因枪转化两种,均需要通过较长时间的组织培养和再生才能够获得完整的突变体植株。然而,组织培养和再生仍是植物基因编辑的限速步骤,对于一些单子叶植物,尤其是对于包含庞大且复杂的六倍体基因组的普通小麦,其基因组编辑尤为困难。开发
用生命“赌”病因,全基因组测序是否能终结求医苦旅?
世界上有近7000种罕见病,约80%罕见病是源于基因缺陷导致的遗传病。但由于人类基因组含有约30亿对碱基对,造成由基因缺陷导致的罕见病不仅种类繁多,还很少见,大部分医生们很难有相关诊断经验,导致罕见病人的诊断之路充满迷雾般的坎坷。有数据显示,全球每个罕见病患者平均看过8个医生、有过3次误诊经历、平均确诊时间长达7年多。
科研人员开发出同时分析全基因组DNA甲基化与遗传变异的方法
中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作,在Briefings in Bioinformatics上,发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneously from double strand bisul
Genome Biol & Sci Adv:基因组的3D结构或会影响机体膀胱癌和儿童脑癌的进展
2021年6月9日 讯 /生物谷BIOON/ --儿童高级别胶质瘤(pHGGs,Pediatric high-grade gliomas)包括多形性胶质细胞瘤(GBM)和扩散型内因性脑桥神经胶质瘤(DIPG,diffuse intrinsic pontine glioma),其均是病态的脑部肿瘤;即使患者经过治疗,其生存率仍然很低,这就使得pHGGs成为了引
Nat Neurosci:全基因组CRISPR筛查揭示神经元在氧化性压力状况下得以存活的关键机制
2021年5月28日 讯 /生物谷BIOON/ --单细胞转录组学能提供不同人类细胞中基因表达的系统图谱,而下一项挑战则是系统性地理解细胞类型的特定基因功能,基于CRISPR的功能基因组学和干细胞技术的整合则能使得分化的人类细胞中的基因功能得到扩展化的分析。当细胞中的单个基因被开启或关闭时,其存在或缺失会影响细胞的功能和生存;日前,一篇发表在国际杂志Natu
利用全基因组测序揭示CRISPR / Cas9在葡萄上的脱靶效应
近日,Horticulture Research在线发表了西北农林科技大学葡萄种质资源与育种团队王西平课题组题为“Whole genome sequencing reveals rare off-target mutations in CRISPR/Cas9-edited grapevine”的研究论文。青年教师王现行与涂明星博士为该