昆明动物所开发出适用于高通量异质性数据算法并成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法（Cross-Value Association Analysis，CVAA）。
Nature：首次对成神经管细胞瘤进行全基因组分析
图片来自Nature, doi:10.1038/nature229732017年7月22日/生物谷BIOON/---在一项新的划时代研究中，来自德国、加拿大、美国、荷兰、丹麦、俄罗斯、西班牙和日本的研究人员对成神经管细胞瘤（medulloblastoma）开展迄今为止最为全面的分析，鉴定出导致75%以上的成神经管细胞瘤的基因组变化，包括仅在这个最少了解的脑瘤亚群中发现的两个新的潜在癌基因。相关研究
Nat Methods：新型基因组工具CITE-seq或能实现单细胞大规模多维度分析
2017年8月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中，来自纽约基因组研究中心（NYGC）的研究人员通过研究开发了一种新技术，或能帮助推动单细胞RNA测序的进程，单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域，其能够帮助研究人员深入解读单细胞的特性，同时还能够帮助有效区分不同的细胞类型，以及在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。图片来源：N
Cell：曹雪涛院士发文揭示I型干扰素诱导抗病毒基因的表达调控机制
2017年7月28日 讯 /生物谷BIOON/ --I型干扰素介导的相关基因的表达（ISGs）对于抗病毒免疫反应具有重要的意义，IFN信号的紊乱会导致一系列感染性疾病以及炎症紊乱的发生。到目前为止，我们对IFNa介导的信号通路已经有了较为深入的了解，但IFNa是如何激活STAT的信号以及ISG的表达目前并不清楚。除了磷酸化以及泛素化之外，蛋白质还存在其它一些少见的翻译后修饰类型，例如甲基化以及乙酰
Neurol Genet：IBM人工智能 高效分析脑瘤基因组
随着肿瘤靶向治疗和个性化治疗方法的不断进步，越来越多的医生意识到了对肿瘤进行基因组测序的重要性。从肿瘤基因组分析中往往能找到更有针对性和更有效的靶向治疗方案，为患者带来更好的疗效。不过，从大量的基因组数据中迅速找到潜在的治疗方案并不是一件容易的事情，但这却是计算机和人工智能程序能够发挥作用的地方。最近，IBM和纽约基因组中心合作发表了一项研究，IBM的沃森人工智能系统在分析
Cell：最大规模基因功能分析揭示出很多潜在的抗疟疾药物靶标
图片来自Cell, doi:10.1016/j.cell.2017.06.0302017年7月16日/生物谷BIOON/---在对疟原虫基因功能的首个有史以来大规模的研究中，来自英国韦尔科姆基金会桑格研究所等研究机构的研究人员发现疟原虫的成功归结于将它的基因组缩小到仅由必需基因组成。他们分析了这种疟原虫基因组中的一半以上的基因，结果发现三分之二的这些基因是它的存活所必不可少的。这也是迄今为止在研究
PLOS Computational Biology:遗传发育所发现组蛋白修饰分工调控基因表达水平和基因表达噪音
基因表达过程依赖于转录因子、染色质调控因子和染色质等生物大分子在布朗运动过程中的随机碰撞，因此，即使是基因型和分化类型完全相同的细胞在相同环境下也存在基因表达的差异，被称为基因表达噪音。研究基因表达噪音，对研究干细胞增殖分化、个体发育、病原菌的抗药性以及农作物的稳产有着重要的意义，而其在人类早期胚胎发育过程中的调节机制仍不清楚。中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究组计
2篇《Nature》文章揭示：多参数基因分析在个性化肿瘤疫苗研发中的运用价值
找到有效攻克肿瘤的方法长期以来一直是研究人员追求的目标，最大的困难之一在于广泛存在的肿瘤异质性，不仅仅在肿瘤组织内部，即使是同一种肿瘤类型，在不同患者间也存在着极大的差异。最新的两项独立研究表明，科学家们可以从肿瘤患者自身找到个性化治疗癌症的方法---个性化的肿瘤疫苗，这两项研究成果同时发表在了《Nature》杂志上。----------------------------------------
新型技术可实现一次性对成千上万个基因克隆并且表达
2017年7月10日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Nature Biomedical Engineering上的研究报告中，来自约翰霍普金斯大学、特伦托大学、哈佛医学院的研究人员通过研究开发了一种名为“LASSO克隆”的新型分子生物学技术，该技术或能同时成功有效分离出成千上万个长的DNA序列，这要或许比以往任何技术都要强大，研究者表示，该技术能够加速蛋白质的产生，从而就能
Cell：对人肝细胞癌进行完整基因组分析
图片来自Cell, doi:10.1016/j.cell.2017.05.0462017年6月17日/生物谷BIOON/---在全世界，肝癌是第二大癌症致死率，但是仅有有限的治疗选择来控制这种疾病。为了更多地了解这种癌症的遗传原因和鉴定肝细胞癌（HCC）的潜在新的治疗靶标，美国贝勒医学院人类基因组测序中心教授David Wheeler和美国梅约诊所医学教授Lewis Roberts领导的