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Science:分析完整人类基因组中的表观遗传模式

2022年4月4日讯/生物谷BIOON/---人类参考基因组已成为许多大规模计划的基础,包括对表观基因组(epigenome)进行编目的集体努力,其中表观基因组是控制基因活动和细胞功能的一组标记和蛋白

2022-04-04

Science:完整人类参考基因组改进了对人类遗传变异的分析

2022年4月4日讯/生物谷BIOON/---人类参考基因组的核心应用之一是作为几乎所有人类基因组研究的比较基线。不幸的是,人类参考基因组的许多困难区域几十年来一直没有得到解决,并且受到塌陷区、序列缺

2022-04-04

Nature:科学家构建基因表达调控DNA序列进化和适应度景观研究框架

 顺式作用元件是位于基因旁侧序列中能影响基因表达的非编码DNA序列。这些顺式作用元件的突变可能影响与基因转录因子相互作用,从而调控基因表达,进而改变生物表型和适应度景观。一个完整的适应度景观由一个适应度函数定义,该函数将序列空间中的每个序列映射到其相关的适应度。但调控DNA序列与适应度建立的映射关系很难可靠地推广到整个序列空间,因此构建完全的适应度

2022-03-24

Neurobiol Dis:揭示阿尔兹海默病患者大脑中基因表达改变的分子机制

来自西班牙的科学家们通过对来自近800名已故个体的大脑样本的遗传数据进行分析,识别出了确定患病的个体大脑中星形胶质细胞和神经元中的基因表达与未诊断为痴呆症的个体(对照个体)的大脑中细胞中基因表达之间的差异,这些样本来自西奈山医学院等三家机构。

2022-03-28

Nature Genetics:科学家通过基因组关联分析确定布鲁加达综合征新的风险位点

布鲁加达综合征(BrS)是一种与年轻人猝死有关的心律失常疾病。除了编码心脏钠离子通道相关基因以外,易感基因在很大程度上仍是未知的。荷兰阿姆斯特丹大学等研究人员发现了布鲁加达综合征新的风险位点,并揭示了疾病中相关钠通道调节的新机制。该论文于近日发表在《Nature Genetics》上,题为:Genome-wide association analyses i

2022-03-19

Nature子刊: 34129例结直肠癌组织中PTEN基因突变的综合分析

2019年,估计有超过14.5万例结直肠癌(CRC)病例,超过5.1万人死亡,使其成为美国癌症发病率和死亡率的第三大常见原因,无论男女。在被诊断为患有远处疾病的患者中,5年的总存活率保持在14%,这促使人们努力通过更好地了解CRC生物学来改进治疗方案。

2022-03-30

Toxicol Sci:空气污染或会通过影响胎盘中的基因表达对女性妊娠产生不利影响

来自德州农工大学等机构的科学家们通过对实验模型进行研究分析了空气污染对胎儿发育的影响效应。他们分析了暴露于不同浓度的超细颗粒物(UFPs,ultrafine particles)对胎儿发育的影响,以及这种暴露如何影响胎盘中某些基因的表达。

2022-03-14

BMC Plant Biology:小粒咖啡种质资源基因组重测序解析研究获进展

   小粒咖啡(Coffea arabica)隶属于茜草科(Rubiaceae),是多年生的重要经济作物。随着特色咖啡需求增加,开发市场需求高的咖啡品种颇为重要。埃塞俄比亚作为小粒咖啡基因库的主要来源,其种质资源具有颇高的价值,可用于培养优良性状的品种。基因组重测序可以促进分子育种,且通过重测序分析产生的标记有助于推进传统作物育

2022-03-03

Annals of Botany:山茶科古杂交事件及基因组加倍研究取得进展

 山茶科隶属于被子植物菊分支杜鹃花目,共包含3族9属约300余种,该科植物多为灌木及乔木树种,具有生态和经济价值。其中,木荷属(Schima)为亚洲特有属,约含20种,该属植物多为森林建群种及乔木层优势种,以木荷为优势种且与其它典型常绿阔叶树种共同组成的“木荷林”,是我国中亚热带地区常见的常绿阔叶林类型。山茶属(Camellia)含约120种,以我

2022-02-21

Science:开发出spatial-CUT&Tag技术,可在空间水平和基因组水平上观察组织发育背后的表观遗传机制

在一项新的研究中,来自美国耶鲁大学和瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员开发出一种技术,使他们能够同时在空间水平和全基因组水平上观察组织发育背后的表观遗传机制,这是一项在多种科学和医学应用上的突破。

2022-02-19