Cell:基因表达和单细胞形态的全身整合
本研究系统地探索了细胞类型特异性基因表达与形态之间的联系。根据基因表达对分段细胞进行聚类揭示了空间连贯的组织。通过对全身连接组学和转录组的全面整合比较内部和之间的细胞和神经回路生物在基因和超微结构水平,更有助于理解生命系统的发展和演变。
ANN ONCOL:低HR表达乳腺癌患者的预后:一项15年人群队列分析
针对低激素受体(HR)表达(1%-9%)乳腺癌患者的治疗,指南上的建议并不明确,一些研究显示HR阴性肿瘤与HR强阳性肿瘤(≥10%)更相似。近段时间S. Schrodi教授及其团队使用了一个基于人群的15年队列,分别比较了HR低阳性肿瘤、HR阴性肿瘤和HR强阳性肿瘤患者的特征和结局。
Nature子刊发现植物在逆境响应过程中存在RNA介导的基因共表达调控网络
真核生物基因组可转录产生大量RNA。这些RNA包括编码蛋白质的mRNA和众多非编码RNA(ncRNA)。ncRNA大致可分为两大类:看家ncRNA(housekeeping ncRNA)和调控性ncRNA。看家ncRNA包括参与蛋白质合成的核糖体RNA(rRNA)、转运RNA(tRNA),参与RNA剪接的snRNA和参与RNA修饰的s
科研人员开发细菌全基因组规模预测IV型分泌系统效应蛋白的新软件
近日,上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室在生物信息学顶级刊物《Briefings in Bioinformatics》(IF:11.622)上发表题为“T4SEfinder: a bioinformatics tool for genome-scale prediction of bacterial type IV secreted eff
IMMUNITY:揭秘炎症基因表达的环境依赖控制相关机制——PGE2-MEF2A轴
近期Francesco Cilenti教授及其团队研究了细胞在复杂环境下的可塑性和适应性原则,并揭示了与感性疾病或癌症相关的IFN I诱导的转录回路。
Nat Genet:大规模的顺式和反式eQTL分析或能识别出调节血液基因表达的数千个遗传位点和多基因分数
来自荷兰格罗宁根大学医学中心等机构的科学家们通过对3万多名个体的基因组学数据进行分析,揭示了能够控制疾病相关基因的数千个新型调节区域,这一资源目前可供全世界的研究人员使用;同时该研究也是向基因组学驱动的精准医学迈进的重要一步,并且有可能能帮助发现一些特殊标记从而揭示哪些患者会因哪种疗法而获益更多。
CANCER IMMUNOL IMMUN:揭秘前列腺癌放疗后免疫相关基因的长期表达变化!
近期,Iris Eke教授及其团队发现了免疫相关基因表达的变化受到放疗方案的影响,这些发现对去势难治性前列腺癌患者的免疫治疗具有重要意义。
Science:研究人员发明平行和连续荧光原位杂交法 可测量单个细菌基因表达情况
加州理工学院研究人员在《科学》杂志上发表研究,介绍其发明的新型平行和连续荧光原位杂交(par-seqFISH)技术,可用于研究细菌种群内的单个细菌基因表达情况,有望成为细胞生物学研究的有力工具。研究人员主要通过基因表达了解细菌动向,而测量基因表达的传统方法通常是把复杂立体的整个细菌种群缩小,导致单个细菌“身份信息”丢失。因此,在微生物研究中,往往观察不到微观