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PLoS Patho:基因组水平揭示绿脓杆菌毒力相关的基因

近日,刊登在国际著名杂志PLoS Pathogens上的一篇研究报告“Genome-Wide Identification of Pseudomonas aeruginosa Virulence-Related Genes Using a Caenorhabditis elegans Infection Model”揭示了美国哈佛医学院研究者的最新研究结果,在报告中,研究者用秀丽线虫感染模型...

2012-11-18

Nature Communications:短花药野生稻基因组测序及分析

稻属是从事植物比较、进化和功能基因组学研究的理想系统。野生稻蕴含着宝贵的基因资源。为了更好地利用稻属的野生资源,美国亚利桑那大学的Rod Wing教授在2009年发起了国际稻属基因组计划(I-OMAP),旨在构建稻属所有物种的全基因组序列图谱,并在此基础上开展比较、进化和功能基因组学研究。

2013-03-18

Cancer Res:基因组测序技术深入剖析前列腺癌

2013年5月26日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,刊登在国际杂志Cancer Research上的一篇研究报告中,来自梅奥诊所的研究者使用新一代的基因组分析技术揭示了,某些恶性的前列腺癌肿瘤具有相似的遗传起源过程,这或许可以帮助研究者来对癌症恶化进行预测。

2013-05-27

Nature Genet:基因组测序发现脑肿瘤亚型新的基因突变

2013年4月15日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,华盛顿大学儿科癌症基因组计划已经确定一个基因突变在一半以上的儿童脑肿瘤亚型低级别胶质瘤(LGGs)中存在。这项研究侧重于脑肿瘤被称为低级别胶质瘤(LGGs),这是一种生长缓慢的癌症,在美国,每年约有700名儿童患此类癌症。对于不能手术切除的肿瘤患者,由于这种病需长期进行治疗,并发症的存在使得疾病治疗前景依然黯淡。

2013-04-15

Nature.Med:基因组DSB作图新方法

近日,科学家提出一种利用全基因组技术进行DNA双链断裂(DSBs)作图新方法,这种作图法以单核苷酸为基本单位,称之为BLESS(direct in situ breaks labeling, enrichment on streptavidin and next-generation sequencing),相关研究论文于2013年3月20日在线发表在Nature Method杂志上。

2013-05-31

Genom Med:基因组测序技术或可鉴别前列腺癌是否转移或复发

2013年4月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,刊登在国际杂志Genome Medicine上的一篇研究报告中,来自格拉茨医科大学的研究者通过研究揭示,非侵袭性的液体活检可以鉴别出前列腺癌是否转移或者复发,这种检测方法成本较低,比较适用于大多数的医疗保健系统。从血浆DNA的分离来看,前列腺癌的基因组学特性表现为染色体特殊区域的异常拷贝。

2013-04-08

Sci Transl Med:基因组测序助力癌症诊断

来自约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家们开发了一种测试方法,利用常规巴氏检测(Pap test)获得的宫颈分泌物来检测卵巢癌及子宫内膜癌。在一项初步研究中,研究人员采用这种命名为“PapGene”的测试方法,依靠全基因组测序癌症特异性突变,检测出了全部24个子宫内膜癌,以及22个卵巢癌其中的9个,准确率分别为100%和41%。

2013-01-10

Nature:胰腺癌基因组分析揭示疾病的新型路径

2012年10月25日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,刊登在国际杂志Nature上的一篇研究报告中,来自贝勒医学院的研究者表示,在对胰腺肿瘤的一项最新的基因组分析中,研究者发现了参与这个疾病发病的两条途径,这就为开发新型以及早期的疾病检测手段提供了帮助。 研究者Fisher表示,如今我们知道了参与胰腺癌发病的每一个基因,这对于我们深入解析该疾病的发病机理带来了巨大帮助。

2012-11-18

基因组选择软件--GVCBLUP 2.1发布

2月21日,明尼苏达州大学杨达教授发布了GVCBLUP 2.1软件,该软件主要应用于基因组选择领域,能有效地利用全基因组的单核苷酸多态标记预测基因组育种值,并估计遗传变异的加性及显性效应。

2013-05-31

Nat Cell Biol:基因组解析人类细胞的分泌过程

在细胞中,不同的基因都处于沉默状态(中间和底部),相比正常细胞(最上面),特殊位点的分泌过程开始进行(绿色代表开始分泌) (Credit: Image courtesy of UCD Conway Institute of Biomolecular & Biomedical Research) 近日,爱尔兰都柏林大学和欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究者共同努力...

2012-11-18