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科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Nature Methods:从序列到结构——RhoFold+深度学习模型实现RNA 3D预测的高效革命

通过结合深度学习和语言模型的力量,RhoFold+实现了对RNA 3D结构的高效预测,克服了传统方法的瓶颈,为RNA功能和应用的深入研究开辟了新天地。

2024-12-01

研究人员设计出基于图表示学习和蛋白质语言模型的深度生成算法

该研究成果推进了深度生成模型用于功能蛋白质设计,为进一步剖析蛋白质设计规律并开展生物实验验证奠定了基础

2024-12-29

个体化肺癌新模型助力肿瘤精准治疗

研究团队开发了基于微量上样策略的液滴微流控技术和具有良好原代细胞生物相容性的水凝胶材料,解决了多种原代细胞共培养活性维持的关键问题。

2024-05-08

Immunity | 王毅全/吕惠彬等开发记忆B细胞语言模型用于抗体特异性预测

研究团队开发了记忆B细胞语言模型(mBLM),使其学习功能性抗体的内在“语法”,并进一步区分血凝素(HA)头部和茎部抗体以及针对其他抗原的抗体。

2024-08-22

Cell Metab | LRP1调控ARF1 K73乳酸化修饰影响星形胶质细胞线粒体外

文章发现LRP1通过减少星形胶质细胞的乳酸生成,降低ARF1的乳酸化修饰水平,从而调控健康线粒体由星形胶质细胞向神经元的传递,这一过程可以拮抗缺血所造成的器官损伤。

2024-06-26

Nature子刊:浙大熊旭深团队开发基于Transformer的语言模型,预测翻译调控并解析疾病变异

该深度学习模型Translatomer为领域提供了研究基因翻译调控的新工具,还为解释复杂疾病中的遗传变异提供了除了mRNA水平之外的重要机制基础。

2024-11-01

Science封面:华人学者开发AI模型,学会生命的语言,生成新型CRISPR系统乃至整个基因组

该研究开发了从分子到基因组尺度都能进行预测和生成任务的基因组基础模型——Evo模型。这是第一个在全基因组规模上以单核苷酸分辨率预测和生成DNA序列的模型。

2024-11-23

上海交大洪亮团队开发扩散概率模型——CPDiffusion,设计生成高活性的人工内切核酸酶

CPDiffusion作为一种强大的全新蛋白质序列设计工具,为生物学家和蛋白质工程设计者提供了全新的可能性,用于设计功能更强大的蛋白质、研究蛋白质功能的逐渐演化过程、丰富现有蛋白质的数据库等。

2024-09-14

Nat Method:单细胞分辨率下对细胞信号交流进行分析的多实例学习模型-Spacia

Spacia模型能够帮助研究者从各种生物学样品的单细胞空间转录组数据中获得新的知识。

2024-09-06