Nat Biotechnol | 揭开肿瘤亚克隆演化之谜:31种算法在模拟肿瘤中的表现评估
为了更好地理解肿瘤的演化过程,研究人员开发了许多基于高通量测序技术的亚克隆重建算法。这些算法利用肿瘤DNA测序数据中的突变特征来推断肿瘤亚克隆的组成和演化历史。
2024-06-13
Nature:胡政/贺雄雷/何真团队揭示早期肿瘤从多克隆至单克隆转变的演化新模式
中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所首次揭示了肿瘤从多克隆向单克隆转变的早期演化新模式,并解析了肿瘤多克隆起源的细胞间通讯与互作机制。这一发现不仅为肿瘤的早期发生机制提供了新的科学视角。
2024-11-04
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
Nature Genetics:单细胞视角下的肿瘤增殖密码——SPRINTER精准解析克隆异质性的新工具
该方法不仅揭示了克隆间增殖率的显著异质性,还关联了高增殖克隆与癌症转移潜力、循环肿瘤DNA(ctDNA)释放等临床重要特征。
2024-12-08
李亚平/王当歌团队开发优选阳离子脂质体,激活STING通路,增强阿霉素诱导的抗肿瘤免疫应答
本研究发现了一种通过激活STING通路恢复IFN-I水平来增强DOX诱导免疫应答的新策略,并提供了实现蒽环类化疗药-STING激动剂高效协同递送的新载体。
2024-10-15
Nat Commun | siRNA扩增的新亚细胞器:E颗粒
课题组通过蛋白组学和细胞学手段鉴定出了5个定位于E颗粒的蛋白,包括EGO-1,DRH-3,EKL-1,ELLI-1和一个新蛋白EGC-1,并揭示了E颗粒参与小干扰RNA扩增的分子机制。
2024-07-19
Cell:由DNMT3A突变驱动的克隆造血促进炎症性骨质流失
来自北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员研究了 DNMT3A 突变与牙周炎和牙龈炎症的患病率和严重程度之间的关联。他们分析了4946名社区居民研究参与者的遗传数据和临床特征。
2024-06-13
江南大学研究发现,这种植物+亚精胺,具有协同抗衰作用
结果表明,铁皮石斛多糖和亚精胺联合使用具有协同抗衰老作用,协同作用可能主要通过改变脂质代谢途径来介导,为抗衰老提供了一种新方向。
2024-09-15