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牛油果无间隙参考基因组组装助力脂肪酸生物合成和抗病性相关基因鉴定

研究显示西印度品种的牛油果包含40629个蛋白质编码基因,应用迭代识别和聚类方法预测出12个染色体特异性的着丝粒序列(CSCR)。

2024-05-16

小麦野生近缘物种簇毛麦基因组组装及抗白粉病分子机制研究方面取得新进展

南京农业大学农学院细胞遗传研究所作物遗传与种质创新国家重点实验室小麦遗传育种创新团队在《Molecular Plant》杂志上发表了题为“A chromosome-scale genome

2023-02-24

萝卜基因组组装与抽薹性状遗传调控机理解析方面取得新进展

萝卜(Raphanus sativusL.) 是原产于我国的十字花科重要根菜类蔬菜作物。高质量基因组组装是分离鉴定基因组结构变异、解析目标性状形成遗传机制的重要基础。

2023-02-09

GigaByte:科研人员组装完成高质量的丹340基因组

玉米不仅是全世界重要的粮食、饲料和生物燃料作物之一,也是遗传学和基因组学基础研究的重要模式植物。

2022-06-20

象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉类植物,原产于中国云南和东南亚地区,具有观赏、饲用和药用价值。

2022-05-13

Cell:染色体水平的油松基因组组装和甲基化研究取得进展

近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了染色体水平的基因组组装和注释,绘制了油松基因组的染色体甲基化图谱

2022-01-01

科研人员开发细菌全基因组规模预测IV型分泌系统效应蛋白的新软件

近日,上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室在生物信息学顶级刊物《Briefings in Bioinformatics》(IF:11.622)上发表题为“T4SEfinder: a bioinformatics tool for genome-scale prediction of bacterial type IV secreted eff

2021-10-22

Nature Genetics:茶树单体型基因组组装揭示茶树的演化史

  由福建农林大学、中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所等多家单位共同合作在国际顶级期刊Nature Genetics上发表“Haplotype-resolved genome assembly provides insights into evolutionary history of the tea plant Camellia s

2021-08-12

研究人员从鲇与大口鲇杂交子一代的基因组中成功组装高质量的双亲基因组

   近日,珠江水产研究所珠江渔业资源调查与评估创新团队在杂交子一代基因组相关研究方面取得新进展,相关研究论文“Sequencing an F1 hybrid ofSilurus asotusandS. meridionalisenabled the assembly of high-quality parental genom

2021-08-26

中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法,并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组

   三代测序技术(PacBio和Oxford Nanopore)可解决基因组重复区域的组装难题,提高基因组完整性,已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中,纳米孔(Nanopore)测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低,并且由于其可实现超长读长(高达1Mbp),在复杂基因组组装中具有天然优势。然

2021-01-15