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单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

利用Leprechaun 的RNA检测解决方案来赢取慢病毒表征大奖

直播内容:利用Leprechaun 的RNA检测解决方案来赢取慢病毒表征大奖。直播时间:2024年2月29日 14:00 - 15:00。

2024-02-20

Nat Biotechnol | RNA结构解析新纪元:一种全新的自动化、高效率的冷冻电镜图谱分析方法

该研究开发了一种基于深度学习的方法,从冷冻电镜图中自动构建全长全原子RNA结构,称为EMRNA

2024-03-08

Immunity:上海交大邹强团队等揭示乳酸介导CTLA-4的RNA剪接以维持Treg细胞免疫抑制功能

结合大数据分析、多种转基因小鼠肿瘤模型及分子生化实验,研究团队发现乳酸能够增强Treg细胞中Foxp3的表达,Foxp3促进剪接体组分USP39的转录与表达。

2024-03-03

Immunity | 邹强/叶幼琼/赵任/倪志宇发现乳酸调节RNA剪接促进CTLA-4在肿瘤浸润调节性T细胞中的表达

该研究证明了乳酸在肿瘤浸润的Treg细胞中触发RNA剪接介导的CTLA-4表达。

2024-03-04

Nature子刊:刘涛团队开发基于RNA编辑的密码子扩展,用于内源蛋白质标记

该研究扩展了内源蛋白标记方法,提供了一个广泛适用的平台,可以在活细胞中标记内源蛋白质,以研究其定位和功能。

2024-02-05

Cell Rep:特殊RNA或能抑制乳腺癌细胞的形成

研究者Holger Bierhoff博士说道,我们已经发现了一种名为PAPAS的长链非编码RNA,其主要作用于DNA的包装并能减少rRNA的产生

2024-01-23

Nature Aging:单细胞RNA测序揭示卵巢衰老的具体机制

总的来说,该研究提供了促进慢性卵巢炎症和纤维化随年龄增长的潜在机制的见解,并为该领域提供了重要的资源。

2024-01-18

清华大学刘俊杰为基因编辑做减法,无需蛋白质的基于RNA核酶的新一代基因编辑工具

该研究阐明了HYER的DNA靶向切割机制,其与众所周知的RNA引导的CRISPR-Cas核酸酶相似,使用可重编程的单链RNA进行DNA识别,并通过水解来切割DNA。

2024-02-05

Developmental Cell:保守界面上的 PUF 合作相互作用决定了 RNA 结合情况和秀丽隐杆线虫的细胞命运

PUF 蛋白在人类健康和疾病中具有重要性,PUF 伙伴关系将很快成为了解人类 PUF 功能如何被调控和发生问题的中心。

2024-02-01