Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。
2024-11-07
Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录组实时测序新技术
该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。
2024-11-03
Cell Rep:刘行/姚雪彪/王志凯合作揭示细胞更新转录调控新机制
该研究发现了书签标识因子FOXA1在细胞有丝分裂期过程中DNA结合模式转变的磷酸化调控机制,以及FOXA1转录凝聚体的形成与功能发挥的分子基础。
2024-09-22
Nature Genetics:赵方庆团队开发高通量三维空间转录组新技术
MAGIC-seq提出了“拼接芯片”的概念,即通过调整网格间距和多轮编码的方式将多个捕获网格拼接在一起,突破了传统微流控方法的通道限制,实现了高分辨率与大视野的兼顾。
2024-09-13
Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析
本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。
2024-06-20
Nat Commun:新研究揭示RNA竟还能帮助细胞修复DNA双链断裂修复
Storici团队发现,RNA可以根据它与断裂DNA链的互补性,影响使用哪种工具。这意味着,RNA 除了是重要的蛋白生产信使外,在 DNA 修复方面还扮演着工头和工人的双重角色。
2024-12-07
科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法
STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。
2024-11-10
Nature Methods:如何利用单细胞RNA测序解读人类胚胎发育的每一步?
随着单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)等技术的引入,研究人员得以从单个细胞的角度揭开胚胎发育的秘密,描绘出生命起始的动态蓝图。
2024-11-24