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WHO:科学家利用超级计算机模拟成功找到能有效抵御COVID-19的潜在活性物质

2020年5月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在World Health Organization网站上的研究报告中,来自美茵茨大学等机构的科学家们通过研究发现,被批准用于治疗丙肝的多种药物或能作为抵御COVID-19的潜在候选药物,COVID-19是由SARS-CoV-2冠状病毒感染所诱发的疾病。图片来源:NIAID这项研究中,研究人员模

2020-05-09

Science:让细胞化身为具有蛋白逻辑门的计算机

2020年4月7日讯/生物谷BIOON/---如今,允许计算机发挥功能的相同基础工具在分子水平上正被用于控制生命。这些进展对未来的药物和合成生物学有影响。在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学医学院的研究人员构建出作为分子逻辑门发挥作用的人工蛋白或者说定制蛋白。这些称为分子逻辑门的工具就像电子逻辑门那样,可用于对更复杂的系统的行为进行编程。他们指出这些新的人工

2020-04-07

COVID-19传播的计算机模型如何帮助我们对抗病毒

2020年3月11日讯 /生物谷BIOON /——利用数学和计算机模拟传染病传播过程的科学家正在研究这种新型冠状病毒,试图预测这种全球疫情可能如何演变,以及如何最好地应对。但有些人说,利用这些建模工具和研究人员的发现,还可以做更多的工作。"这是一种临时的、自愿的努力,我认为这是我们可以改进的地方,"约翰霍普金斯卫生安全中心的传染病建模师Caitlin Rive

2020-03-11

联合全世界闲置计算机来研究新冠病毒,斯坦福推出新项目

 全世界闲置的计算机联合起来!日前,由斯坦福大学潘德实验室(Pande Lab)主持的Folding@home分布式计算项目,正式向全世界发出邀请,寻找志愿者利用家里闲置的计算机,帮助研究人员开发新型冠状病毒的治疗方法。Folding@home(简称FAH)成立于2000年10月1日,是一个研究蛋白质折叠、误折、聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算

2020-03-05

PNAS:计算机技术帮助揭示癌症恶化的分子机制

近日,费城儿童医院(CHOP)领导的一项研究揭示了蛋白质可变剪切与促癌基因之间的联系。相关结果发表在《PNAS》杂志上。

2020-02-19

基于开关电路的DNA计算研究取得进展

 近日,中国科学院上海高等研究院光源科学中心物理生物学研究室、中国科学院上海应用物理研究所和上海交通大学合作开发了一种基于DNA链置换反应的开关电路来实现数字运算。与常用的逻辑门电路相比,开关电路结构精简,可以用最少的DNA序列实现高信噪比和快速计算的分子电路。他们展示了迄今为止最为快速的4位平方根运算。相关论文以Implementing digi

2020-01-17

华大智造 “超级生命计算机”DNBSEQ-T7 正式交付

2019年9月9日,由深圳华大智造科技有限公司(以下简称“华大智造”)自主研发的超高通量基因测序仪——DNBSEQ-T7正式交付商用,首批测序仪已抵达华大基因科技服务有限公司和微基因(WeGene)等合作伙伴的实验室。来自交付前的用户测试数据表明,T7数据表现符合预期,各项指标均表现良好。作为“全球日生产能力最强”的基因测序仪,DNBSEQ-T7自发布就拥有多个“光环”:“首个4联芯片的测序平台”

2019-09-09

PLOS Med:计算机辅助诊断程序让医生更早发现脑肿瘤的生长

2019年6月3日讯 /生物谷BIOON /——根据近日发表在开放获取杂志《PLOS Medicine》杂志上的一项新研究,一种计算机辅助诊断过程可以帮助医生更准确地发现较低级和体积比较小脑部肿瘤的生长,该研究由来自伯明翰阿拉巴马大学的Hassan Fathallah-Shaykh及其同事们一起完成。然而,还需要更多的临床研究来确定早期肿瘤生长检测所支持的早期治疗干预是否能延长患者的生存时间并改善

2019-06-03

Gen Res:新型计算机工具有助于基因鉴定

2019年5月9日 讯 /生物谷BIOON/ --就像在大海捞针一样,识别与特定疾病有关的基因可能是一个艰巨而耗时的过程。为了改善这一过程,由贝勒医学院的研究人员领导的团队开发了一种新的生物信息学工具,可以分析CRISPR合并的筛选数据,并以比其他现有方法更高的灵敏度和准确度确定潜在相关基因的候选基因。新的基于网络的分析工具也更快,更友好,因为它不需要生物信息学培训来使用它。该研究发表在《Geno

2019-05-09

Sci Rep:计算机成像技术揭示肿瘤内血流信号

2019年5月7日 讯 /生物谷BIOON/ --约翰·霍普金斯大学医学研究人员表示,他们开发了一种类似于“谷歌地图”的方法,可以更准确地计算和可视化肿瘤生长所需的结构和功能性血管变化。通过将来自动物模型的肿瘤标本的高质量3D成像数据与复杂的数学公式配对,研究人员表示,他们现在拥有一个能够准确表示肿瘤内血液流量的模型,包括复杂的血流量,氧合作用和发生的结构变化。这项工作于3月27日在Nature

2019-05-07