Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
Nature | 曹佳雨等揭示DNA激活的AIM2炎症小体通路是导致早期卒中复发的关键机制
本研究揭示了初次卒中后细胞游离DNA激活的AIM2炎症小体通路是导致动脉粥样硬化性卒中复发的关键机制。
2024-08-17
Oncotarget:剔除半胱氨酸等非必需氨基酸促进癌细胞遭受DNA损伤和死亡
使用一种工程化的半胱氨酸/胱氨酸酶(cyst(e)inase)来剔除半胱氨酸/胱氨酸,可以诱发癌细胞中的氧化应激和 DNA 损伤。
2024-06-29
NCB:黄韵/周育斌团队揭示TET2选择性调控DNA去甲基化与基因转录的关键机制
该研究的结果提示破坏TET2凝聚体的形成可以成为血液癌症治疗的新靶点,为相关临床研究提供了新思路和方法。
2024-09-12
Nat Commun丨张勇与阮珏团队合作开发低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术LILAP
LILAP作为一种三代低DNA输入量的建库方法,在不扩增的前提下将PacBio测序DNA投入量降低至100 ng,适应于解析小型生物及其内共生体基因组。
2024-07-16
Nature: 新开发的TATSI技术利用转座元件将定制DNA整合到植物基因组的特定位点
TATSI 技术利用了植物转座元件 20 多亿年进化的优势,这些转座元件就像经过磨练的分子机器,自然而然地将 DNA 导入宿主基因组中。
2024-07-14
Nature子刊:北京大学胡家志团队揭示基因编辑的新风险——导致线粒体DNA片段整合到细胞核基因组
研究团队利用PEM-seq发现,在mitoTALEN编辑后线粒体DNA与核基因组整合序列的断点大多发生在mitoTALEN的编辑窗口内。
2024-11-13
哈佛团队发现,DNA甲基化是连接童年逆境与抑郁症的桥梁
基于人体血液的表观基因组DNA甲基化数据、童年经历和抑郁状态等数据,找到了70个胞嘧啶-鸟嘌呤二核苷酸(CpGs)位点,并发现它们可以解释逆境与抑郁症状之间10-73%的相关性。
2024-12-09