罗氏NimbleGen序列捕获技术在农业研究中的应用
近几年来,高通量测序技术在现代农业研究中得到了越来越多的应用,为新品种选育和品质改良带来了新的科研方法和解决方案。然而,研究者想要对农作物基因组进行深入分析依然面临诸多挑战。一方面,植物的基因组比较复
PNAS:揭示三阴性乳腺癌中的特殊串联重复表型结构
来自美国杰克逊实验室(Jackson Laboratory)的研究人员近日通过研究在某些致死性的女性癌症患者机体中发现了特殊的分子指纹,这种基因组的结构被描述为一种串联重复的表型(TDP,tandem duplicator phenotype),这种结构主要存在于在三阴性乳腺癌、严重的卵巢癌及子宫内膜癌患者机体中,相关研究刊登于国际杂志PNAS上。
Nat Biotechnol:新检索方法可在几分钟内找到靶DNA序列
多亏美国卡耐基梅隆大学计算机科学家们开发出的一种新的检索方法,如今从数据库中检索靶DNA序列只需几分钟时间就可完成。
Bioinformatics:新算法将更好组装DNA序列 检测特殊遗传突变
刊登在国际杂志Bioinformatics上的一项研究论文中,来自杨百翰大学(Brigham Young University)的研究人员开发了一种新方法来进行人类基因组的装配,而且这或许可以帮助鉴别引发常见遗传障碍的新型突变。
Biomicrofluidics:利用时间序列数据高准确率地绘制基因组图谱
2016年1月5日讯/生物谷BIOON/如果你已经有了一种有机体的基因组序列图谱,但想在图谱中找到异常结构,那么你可以通过在一些靶点中切断DNA序列并检测切割点之间的距离来检查基因条码。然而,原始基因图谱在允许研究有
Nat Genet:看似无用的重复性DNA或发挥着巨大的作用
近日,一项刊登在国际著名杂志Nature Genetics上的研究论文中,来自纽约哥伦比亚工程和基因组中心的科学家们通过对基因表达的短串联重复序列(STRs)进行全基因组关联性分析发现,被认为无作用或者“垃圾”的STRs实际上在调节基因表达上扮演着重要的角色,相关揭开了调节基因表达的一类新型的遗传突变。
The ISME J:CRISPR序列帮助理解噬菌体-宿主相互作用的演变历史
近日,一项刊登在国际杂志The ISME Journal上的研究报告中,来自美国能源部联合基因组研究所的研究人员利用来自北加州铁山公司的宏基因组数据库和专门的工具,在CRISPRs的帮助下成功地在生态系统研究中将宿主和噬菌
Cell:中国科学家揭示CRISPR获取新间隔序列的分子机制
10月15日,Cell 杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽研究组关于CRISPR-Cas系统中外源片段获取阶段的研究进展。
实验的可重复性差都有哪些原因?
在上个月末的《Science》杂志上,美国弗吉尼亚大学的Brian Nosek作为通讯作者,发表了题为《Estimating the reproducibility of psychological science》的研究文章。文中,研究者们提到,尽管他们能够重复出最近的1