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Genome Biology:科研人员开发出在单细胞中识别染色质类染色质拓扑相关结构域结构的算法

  基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来,单细胞水平下的Hi-C研究成为三维

2021-08-02

Science、Nature同日发文,50年生物学难题迎来两款AI产品破局

蛋白质(protein)是构成生命体的重要物质,其功能在很大程度上取决于它独特的三维结构。在过去的50年里,“蛋白质折叠问题”一直是生物学界最大的谜团之一。尽管X 射线晶体学和冷冻电子显微镜等实验技术的加入已经帮助确定了约10万种蛋白质结构,但与人体内数十亿已知蛋白质序列的相比,可谓是杯水车薪。转折出现在2018年,曾开发了著名人工智能围棋程序AlphaGo

2021-07-16

Nature子刊:试验表明AI引导有助于在常规实践中早期发现心脏疾病

某些类型的心脏疾病可能很难发现,例如无症状的低射血分数,特别是在治疗最有效的早期阶段。心电图AI引导下的低射血分数筛查(EAGLE)试验旨在确定利用心电图数据开发的人工智能(AI)筛查工具是否能改善常规实践中这种病症的诊断。根据发表在《自然—医学》上的研究结果,答案是肯定的。收缩期低射血分数定义为心脏无法在每次跳动时足够强烈地收缩,以从其腔室中抽出至少50%

2021-05-09

从CRO到AI药物研发:大平台的故事还能讲多久?

  把时间拉回到2015年12月,彼时还是纳斯达克中概股的药明康德,在某日收盘后宣布将以33亿美元完成私有化。作为当年第25家从美股退市的中概股,回归A股自然是下一程。只是,面对医药行业之外的海量非专业投资者,如何讲清楚这家CRO巨头的价值,颇令卖方分析师有些头疼:既要通俗易懂,又要想象空间无限,单纯外包服务显然是不够性感的。思前想后,券

2021-04-19

专注AI药物研发智化科技完成A轮融资

 智化科技近日宣布完成超3000万人民币的A轮融资,由红杉中国种子基金领投,巢生资本与老股东峰瑞资本跟投,融资所得主要用于市场拓展,新方向的探索与资深研发人才的招募。此前,该公司曾在2019年完成天使轮融资。在新药研发行业里,一个化合物从发现设计到最后的成药上市,平均周期需要13年,总成本更是高达17亿美元,其中,临床前先导化合物的发现和优化平均花

2021-03-08

PNAS:科学家利用机器学习算法来识别人类基因组中的古老RNA病毒片段!

2021年2月4日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中,来自日本多个研究机构的科学家们通过研究,成功利用机器学习算法来从人类基因组中识别古老的RNA病毒残留物,文章中,研究人员描述了他们如何教授AI系统来识别RNA病毒残留并利用其在

2021-02-04

科学家们如何利用算法来加速人类疾病研究?

本文中,小编整理了多篇研究报告,共同聚焦科学家们如何利用算法来加速人类疾病研究?分享给大家!【1】Diabetes Care:新研究发现多种人工智能算法在检测糖尿病视网膜病变方面存在性能差异doi:10.2337/dc20-1877糖尿病仍然是美国成人失明新病例的主要原因。糖尿病视网膜病变是导致视力下降的最常见的糖尿病相关眼病。但是,目前缺乏眼科保健提供者,

2021-01-24

加拿大研究人员创建用于药物发现的新型蛋白质折叠算法

  据多伦多大学网站报道,该校唐纳利细胞与生物分子研究中心(Donnelly Centre for Cellular and Biomolecular Research)的计算生物学家开发了一种人工智能算法,可用于发现用于精准治疗的全新蛋白质分子。相关论文已发表在《细胞系统》(Cell Systems)杂志上。由分子遗传学教授菲利普·金(

2021-01-13

UCSD研究人员利用AI技术发现新DNA启动码

  近日,加州大学圣地亚哥分校(UCSD)研究人员在《自然》杂志上发表研究,介绍其使用人工智能技术发现了新的DNA启动码“下游核心启动子区”(downstream core promoter region-DPR),有望在生物技术和生物医学应用领域用来控制基因启动。据研究人员介绍,DNA接收到A、C、G、T这4种碱基的编码指导后发出精确指

2021-01-13

中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法,并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组

   三代测序技术(PacBio和Oxford Nanopore)可解决基因组重复区域的组装难题,提高基因组完整性,已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中,纳米孔(Nanopore)测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低,并且由于其可实现超长读长(高达1Mbp),在复杂基因组组装中具有天然优势。然

2021-01-15