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Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础

Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。

2024-05-26

Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

Nature:从随机搜索到精准激活——翻译起始的新机制

研究发现,eIF4F不仅能够随机探索mRNA的不同位置,还能通过其内部亚基间的协作,在识别帽端时表现出独特的“选择性”和“活化”模式。

2024-12-18

Cancer Discov:新研究揭示Survivin基因促进基底细胞癌起始和进展机制

在皮肤干细胞中而不是在皮肤祖细胞中,介导癌症起始能力的机制是什么?皮肤干细胞中是否存在使其具有这种能力的特定机制?

2025-02-17

Nature:新研究揭示RNA控制着多样性引发逆转录因子的逆转录

RNP相互作用和主动构象Ghosh实验室发现这种RNA包裹bRT并位于桶形Avd上方,形成一种紧密的核糖核蛋白(RNP)。这种核糖核蛋白中丰富的基本相互作用精确地将RNA同源双链定位在bRT活性位点,

2025-01-29

复旦大学发表RNA转录最新Nature论文

本发现揭示了 RNA 聚合酶 III(Pol III) 在高需求小 RNA 的 3 型启动子上的动态变化和重新启动机制的分子层面见解,其中包含了最早记录的 RNA 聚合酶的起始 - 延伸转变。

2025-06-06

Nature:科学家揭秘基因调控的“语言密码”——转录因子如何“对话”?

本文研究不仅扩展了科学家们对基因调控“语言”的理解,还为未来的计算模型提供了新的数据。

2025-04-11

Science:利用Perturb-multiome方法确定转录因子如何驱动血细胞生长和成熟

这种新的Perturb-multiome方法使得研究人员能够系统地揭示数千种转录因子变体如何影响血细胞生成和疾病风险,为寻找更多针对血液疾病的新型靶向疗法创造了机会。

2025-04-08

Nat Cell Biol:单细胞新RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录原理

通过改进的单细胞新RNA测序技术(NASC-seq2),研究深入揭示了转录爆发的动力学原理,发现了合成率在决定转录爆发规模中的关键作用。

2024-09-26

Cell:新研究揭示考拉对考拉逆转录病毒的基因组免疫

逆转录病毒可导致严重疾病,并在塑造人类进化方面发挥了显著作用。

2025-03-17