Science：新型计算策略有望开发大环肽类药物
2017年12月20日/生物谷BIOON/---一项新的研究报道的新型计算策略可能有助开发基于肽的药物。肽类似于蛋白分子，但具有较小的尺寸，不同的结构和功能。大环肽（macrocyclic peptide）已引起制药行业的关注，这是因为它们具有的某些理化性质可能成为开发新一代药物的基础。小肽具有小分子药物（如阿司匹林）和大分子抗体药物（如利妥昔单抗）的益处，具有更少的缺点。它们像小分子一样稳定，而
第一届太湖·生物芯概念计算研讨会——以芯片技术推动数字化生物科技变革
由军事科学院辐射医学研究所伯晓晨研究员、数学工程与先进计算国家重点实验室副主任韩文报教授、中国科学院武汉病毒研究所刘翟研究员、数学工程与先进计算国家重点实验室权建校副研究员共同召集的第一届太湖·生物芯概念计算研讨会于2017年12月5日在无锡召开。 本次会议由国防创新特区生物交叉领域专家组发起，数学工程与先进计算国家重点实验室、国家超级计算无锡中心、江苏微锐超算科技有限公司联合承办。来自
Nat Commun：如何做到利用计算机调控细胞的行为？
2017年12月5日/生物谷BIOON/---最近，来自法国巴斯德研究所以及来自奥地利科学技术研究所的研究者们在《Nature Communications》杂志上发表了两篇文章，展示了利用计算机调控细胞事件的技术。这一技术结合了显微成像以及相关计算机软件，能够帮助研究者们通过已有算法实时观察细胞的活动情况。这两篇文章揭示了这些手段能够帮助对细胞群体的行为进行便捷地重编程操作。从外部调控细胞的活动
NovelBrain®云计算平台充值送豪礼！
烈冰科技历时八年、精心开发的NovelBrain®云计算平台是一套集高性能计算、数据管理和生物大数据深度挖掘于一体的整合分析平台。平台集成多个软件工具、标准化分析流程，并可自主定制分析流程。简单来说，就是让你零代码自主做数据分析的在线平台，拿到原始数据，上传到NovelBrain®云计算平台，就能自己一键完成数据分析。之前烈冰推出的上线特惠试用活动和培训班讲座深受欢迎，为了回馈大家
利用定量微生物组谱计算你的健康
图片来自Nature, doi:10.1038/nature24460。2017年11月18日/生物谷BIOON/---大量的代谢疾病和炎性疾病与肠道微生物组的组成和代谢潜力发生变化相关联。到目前为止，基于测序的肠道菌群研究已从微生物组组成的比例变化角度描述了这些肠道菌群失调（dysbiotic）状态。然而，在一项新的研究中，比利时鲁汶大学的Jeroen Raes教授和他的团队发现，当涉
同济大学刘琦教授课题组在Cell旗下刊物《Trends in Pharmacological Science》发表论文系统探讨肿瘤免疫检查点抑制剂疗效预测的计算生物学问题
肿瘤免疫治疗被认为是近年来癌症治疗手段中最有希望的方法之一。免疫检查点抑制剂（immune-checkpoint blockade）通过解除肿瘤细胞对免疫细胞的抑制通路，激活免疫细胞消灭肿瘤。虽然免疫检查点抑制剂在多类肿瘤治疗中表现出了令人振奋的临床效果，但在实际应用中仍然会出现响应率低，个体化差异大等临床问题。如何基于特定的biomarkers以及计算模型，对于肿瘤患者进行有效的个体化的免疫检查
Nature：计算机辅助设计的迷你蛋白可能成为新类型药物
图片来自：https://www.nics.tennessee.edu/2017年9月29日/生物谷BIOON/--- 科学家已经创造了一种高通量、快速的方法，可以从头开始设计并生成数千种不同的、微型的、稳定的蛋白质，可以结合特定的治疗靶点。 华盛顿大学医学院生物化学教授和他的同事在9月27日《Nature》上发表的文章中报道了他们的发现。防治传染病（ 如流感 ）和开发针对神经毒素的解毒剂是该研究
Nature Methods：中山大学中山眼科中心团队发表三代测序计算方法
9 月 18 日，中山大学中山眼科中心谢志、肖传乐、谢尚潜，以及中山大学数据科学与计算机学院陈颖和克莱姆森大学罗峰等学者，在 Nature Methods 在线发表了三代基因组测序数据计算方法，文章题目为 “MECAT： fast mapping， error correction， de novo assembly tool for single-molecule sequencing read
Nat Biotechnol：科学家开发出能从癌症序列中有效筛选出微卫星突变的新型计算机分析工具
2017年9月14日 讯 /生物谷BIOON/ --日前，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中，来自MIT博德研究所等机构的研究人员通过研究开发了两种名为MSMuTect和MSMutSig的新型计算机工具，这两种工具或能帮助揭示微卫星(microsatellites)序列突变的频率以及其如何诱发癌症。图片来源：Susanna M. Hamilton微卫星是短的D
利用RNA计算纳米设备开展复杂的细胞逻辑运算
图片来自Wyss Institute at Harvard University2017年8月5日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国亚利桑那州立大学、哈佛大学、麻省理工学院和布罗德研究所的研究人员证实了活细胞能够经诱导以一种微型机器人或计算机的形式执行计算。相关研究结果发表在2017年8月3日的Nature期刊上，论文标题为“Complex cellular logic comp