Nucleic Acids Res:新型神经网络可更准确地评估CRISPR/Cas系统的DNA编辑效果
在一项新的研究中,来自俄罗斯科学院、斯科尔科沃科学技术研究所和美国国家生物技术信息中心的研究人员提出一种新的神经网络架构,可用于评估为基因编辑实验选择向导RNA(gRNA)的效果。他们的方法将促进用流行的CRISPR/Cas技术进行更有效的DNA修饰,因此将有助于开发新的策略来构建转基因生物,并找到治疗严重遗传性疾病的方法。
Cell Syst:科学家开发出新型神经网络 或有望揭示大脑发挥功能的分子机制
来自贝勒医学院等机构的科学家们通过研究揭示了大脑中的详细细胞架构以及其内部是如何发生细胞间通讯的。文章中,研究人员使用了先进的计算方法来帮助理解大脑的复杂结构和功能,这或许有望帮助解释在疾病和健康状态下复杂器官的表现。
中山大学生命科学学院RNA组学团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库
中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚合酶 III 转录的 ncRNAs 转录组数据。Pol3Base 的
CircRNA-miRNA-mRNA相互作用网络在糖尿病及其相关并发症中的作用
大多数非蛋白质编码的RNA被鉴定为具有参与细胞内稳态的多种功能。环状RNA(CircRNAs)是一种非编码转录本,在许多生理和病理状态的发生和发展中起着关键作用。
Nature Communications:研究揭示脊髓室管膜瘤肿瘤微环境和多种细胞的互作网络
室管膜瘤是发生在儿童和成人中枢神经系统(CNS)的神经上皮恶性肿瘤,常见发生于幕上、颅后窝和脊髓位置。与脑部室管膜瘤多发生于儿童不同,脊髓室管膜瘤多见于成人。手术切除是目前脊髓室管膜瘤的主要治疗方法,但不是所有病人均具备全切除手术条件。对于不接受辅助放化治疗的次切除患者,肿瘤复发率高达50%-70%。因此,发现新型治疗靶点和治疗策略对于临床室管膜
Cell Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比如目前全球范围内流行的COVID-19疫情,严重威胁
保护性耕作土壤微生物群落网络及装配机制研究取得进展
东北黑土是我国重要的土壤资源,在保障国家粮食安全和生态安全上具有重要地位。然而由于长期不合理的传统农业耕作模式,导致土壤侵蚀、土壤有机质下降、土壤养分和水分库容变小,土壤退化问题严重。近年来,以减少耕作频率及秸秆还田为核心的保护性耕作技术被广泛应用,保护性耕作通过增加外源有机物输入、减少土壤扰动,有效降低了土壤侵蚀强度,促进了土壤有机
Molecular Psychiatry发表 揭示神经调控手术治疗强迫症的脑网络机制
日前,北京大学心理与认知科学学院、北京大学麦戈文脑科学研究所、北大-清华生命科学联合中心研究员王征实验室在国际学术期刊Molecular Psychiatry上在线发表题为“Common and differential connectivity profiles of deep brain stimulation and capsulotomy in re
Genes & Devel:科学家识别出了驱动人类胚胎干细胞行为的核心遗传网络
来自布莱根妇女医院等机构的科学家们利用全基因组遗传筛查技术,在hESCs中过表达并失活了数以万计的基因,结果他们发现了一种能同时控制细胞多能性和细胞凋亡准备状态的关键网络,从而就能帮助确保胚胎发育的最佳条件;相关研究结果或能为癌症遗传学研究提供新的见解,并为再生医学研究提供新的方法。
Nature子刊发现植物在逆境响应过程中存在RNA介导的基因共表达调控网络
真核生物基因组可转录产生大量RNA。这些RNA包括编码蛋白质的mRNA和众多非编码RNA(ncRNA)。ncRNA大致可分为两大类:看家ncRNA(housekeeping ncRNA)和调控性ncRNA。看家ncRNA包括参与蛋白质合成的核糖体RNA(rRNA)、转运RNA(tRNA),参与RNA剪接的snRNA和参与RNA修饰的s