Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
戴俊彪/闫建斌团队通过纳米孔测序,破解模式生物小立碗藓的染色体数目之谜
该研究首次构建了端粒到端粒无间断的小立碗藓参考基因组,证明了小立碗藓的染色体数目为26条,为基于苔藓模型的演化生物学,基因组学及其它基础研究提供了高质量参考基因组。
2024-02-02
三代纳米孔测序研究m6A的方法学取得新进展
目前生物界中已经有超过150多种的RNA修饰碱基被报道,其中N6-甲基腺嘌呤(m6A)在脊椎动物中含量最为丰富,也是被研究得最为透彻的一种修饰碱基。目前检测m6A主要是基于二代测序的方法
2023-05-03
柳叶刀子刊:北大沈宁团队基于国产纳米孔测序平台发表临床多重耐药研究新发现
该论文基于齐碳纳米孔基因测序平台,对临床新出现的携带tmexCD-toprJ的肺炎克雷伯菌进行了广泛研究,是对其流行病学研究的有效补充。
2022-12-12
纳米孔测序新突破:南京大学黄硕团队构建高分辨纳米孔全面绘制RNA修饰图谱
该方法无需对RNA消化产物预分离,可快速定量鉴定天然RNA中的已知和未知修饰,为发展边切边测的纳米孔表观遗传测序提供了重要的设计策略和研究方法。
2022-07-20
即将开播:纳米孔测序癌症研究应用进展系列2——神经系统肿瘤
5月24日,我们邀请到德国基尔大学医院、德国马克思-普朗克研究所、德国癌症研究中心和泰国国立玛希隆大学的研究人员分享他们利用纳米孔测序技术对神经系统肿瘤分型,预后标志物研究等方向的研究成果!
2022-05-23
Nature Biotechnology:超快速纳米孔测序7小时发现致病基因突变
全基因组测序(WGS)可以让科学家看到一个人完整的DNA序列构成,其中包含从眼睛颜色到遗传疾病的所有信息。因此,基因组测序对于诊断患者涉及DNA的疾病至关重要——一旦医生知道了特定的基因突变,他们就可以相应地制定治疗方案。在对病人进行全基因组测序并分析结果,往往需要耗时几周时间,这已经被大多数医生认为是快速了。但对于一些急性病患者,这个时间显然还
2022-04-01