Cell：樊荣团队开发全球首个临床级福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本的空间全转录组测序技术
在约2300种已知的人类成熟microRNA中，Patho-DBiT在MALT切片中检测到了1352种microRNA，其映射序列的长度峰值为21个核苷酸，与此类小RNA的已知长度完全一致。
2024-10-04
Nat Methods | 田鲁亦/刘晓东团队系统性评估11种空间组学技术
通过评估，不同技术方案各有优劣，并且一些国产的技术平台的指标已经达到领先，凸显了中国在这一新兴领域的快速发展趋势。
2024-07-16
单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测，并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析，具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱：CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异（allele-specific CNAs）。
2024-11-27
Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱，CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异，还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹，绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nature Genetics | BANKSY：革命性算法，重塑空间组学数据分析
随着生物技术的快速发展，空间组学数据的产出呈现爆炸式增长，传统的数据分析方法已难以满足研究的需求。BANKSY算法的开发旨在解决这一问题。
2024-03-05
Nature：科学家利用空间蛋白质组学技术开发出治疗人类中毒性表皮坏死的新疗法
本文研究揭示了JAK/STAT和干扰素信号通路或能作为驱动中毒性表皮坏死发生的关键致病性驱动因素，并阐明了靶向性JAK抑制剂作为一种新型治疗性手段的巨大潜力。
2024-10-24
李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响
本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术，探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。
2024-04-12
【报名倒计时】2024空间多维组学创新转化研讨会，4月12日上海开幕！
“2024空间多维组学创新转化研讨会”，将于4月12日在上海召开！诚邀国内多位科学家、临床专家和行业专家分享各自领域的空间多组学应用及研究进展，探讨与推动医学领域的创新转化。
2024-04-01
