Science：揭示完整人类基因组中重复序列的转录和表观遗传状态
2022年4月4日讯/生物谷BIOON/---转座因子（transposable element）、重复序列扩张（repeat expansion）和重复序列介导的结构重排在染色体结构和物种进化中起着
Molecular Biology and Evolution:揭示青藏高原沙蜥属物种杂交带生殖隔离维持的基因组学机制
物种形成是进化生物学研究中基础且重要的问题，长期受到关注。厘清物种间生殖隔离形成的进化过程，对于探索物种形成这一科学理论问题至关重要。生殖隔离的建立和维持是物种形成过程中不同的阶段：建立是与生殖隔离
Nucleic Acids Research：同济大学王晨飞团队开发空间转录组分析算法——STRIDE
近些年，高通量单细胞测序技术的发展，使得研究人员能够在单细胞分辨率研究复杂生物系统中细胞的异质性，但在实验过程中需要经历组织消化等操作，导致细胞在组织中原始位置信息的丢失。新兴的空间转录组学技术则在定量基因表达水平的同时，保留了细胞的空间信息，研究人员得以在空间背景下研究细胞不同的功能状态以及细胞间的相互作用。然而，由于技术的限制，目前大多数空间转录组或是检
Cell Reports小鼠胚胎早期内耳神经节单细胞转录组及其发育轨迹特征分析研究获进展
Cell Reports在线发表了题为Single-cell transcriptomic landscapes of the otic neuronal lineage at multiple early embryonic ages的研究论文，该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中
代谢组学揭示线虫脂肪代谢途径
通过高分辨率质谱的非靶向代谢组学可以揭示单个样本中超过10万个分子特征，其中许多可能代表未知的代谢物。这些代谢物中的许多可能具有重要的生物功能，如细胞内或细胞间的信号分子，如激素，或组织间水平上的沟通媒介，如宿主与微生物的相互作用或信息素。然而，代谢产物的高度不规则和经常不可预测的结构，对其系统的化学和生物学注释构成了很大的挑战。
Nature Biotechnology：科学家验证人类干细胞分化得到的胰岛细胞的功能、代谢及转录组情况
移植来自人类多能干细胞的胰岛细胞是一种潜在的糖尿病治疗方法。现阶段尽管在诱导干细胞分化的胰岛细胞（SC-islets）取得了进展，但对其功能特性尚未进行深入研究。芬兰赫尔辛基大学研究团队对干细胞分化得到的胰岛细胞从功能、代谢和转录情况等多个方面进行了全面评估。该研究成果于近日发表在《Nature Biotechnology》上，题为：Functional，
Nature子刊：浙大团队揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一，是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展，但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想，我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。近年来，随着宏基因组测序等研究手段的不断进展，人们发现肠道菌群能广泛影响宿主细胞的生理和病理功能，并揭示了多种微环境细菌能够参与结直肠癌
乳腺癌临床样本的蛋白质组学揭示潜在生物标志物和治疗靶点
近年来，乳腺癌的基因组分类取得了进展，显着提高了乳腺癌的诊断水平，并进一步改善了患者的预后。但基于蛋白表达谱的新分类已经被提出，能更可靠地揭示支持乳腺癌异质性的功能表型差异，是目前临床试验和治疗决策的主要手段。