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Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-23

Nature Methods :“等深度”模型重塑空间生物格局!深度学习与空间转录的完美结合

GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。

2025-02-01

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

黑箱渐开:表观基因组如何绘制胚胎发育蓝图

本研究为我们系统揭示了早期哺乳动物胚胎中表观基因组的惊人动态。

2025-05-30

Nature作者等专家齐聚,空间全链条解决方案研讨会邀您参与

你是否在空间组学研究中遇到过以下难题?

2025-05-22

Nature:用条形码标记基因组中的顺式调控元件提供了对人类基因组的深入了解

在这项研究中,这些作者基于大规模实验数据,开发了几种机器学习模型来预测顺式调控元件(CRE)的调节活动。

2025-01-20

假根羽藻适应潮间带环境的基因组进化研究获进展

研究为假根羽藻高质量基因组以及藻类基因组高效去污染和组装提供了新策略,拓展了学界对假根羽藻适应潮间带环境的基因组基础的认识。

2025-04-14

科学家破译枸杞子基因组图谱

该研究基于三代测序技术、光学图谱技术、自研高效三维基因组捕获技术等方法,对枸杞进行de novo的基因组组装,突破枸杞基因组高杂合、高重复的瓶颈,获得枸杞高精度基因组图谱。

2024-12-31

Cell:郭国骥团队开发女娲系列模型破译脊椎动物基因组天书

这项研究不仅开发了一款超高通量超高灵敏度的细胞图谱绘制工具,更创造了强大的基因组AI模型。

2025-07-14

基因组时代开启,精准医疗迎来新基石

通过对来自全球28个不同群体的65个个体进行深度测序,构建了130个高质量的单倍型解析基因组。

2025-08-03